Pregleduje genetiko (Marec 2020)

MikroRNA v mreži Hox: navidezna povezava s posteriorno razširjenostjo

MikroRNA v mreži Hox: navidezna povezava s posteriorno razširjenostjo

Izvleček Transkripcijski faktorji Homeobox (Hox) dajejo vretenčnim hrbtnim zarodkom osno-zadnje (AP). Hox geni najdemo v grozdih, ki vsebujejo tudi gene za mikroRNA (miRNA). Naša analiza predvidenih ciljev miRNA kaže, da miRNA v mikroskopi v Hox prednostno ciljajo mRNA Hox. Poleg tega so domnevni Hox ciljni geni večinoma nameščeni na 3 'strani vsakega lokusa Hox miRNA. Ti re

Na kratko

Na kratko

Genetski zasloni Genomska transgena knjižnica RNAi za pogojno inaktivacijo gena v Drosophili . Dietzl, G. et al . Narava 12. julij 2007 (doi: 10.1038 / nature05954) Ta članek poroča o nastanku in potrjevanju obsežne transgene knjižnice za presejanje RNAi v Drosophila melanogaster , kar omogoča analizo genskih funkcij v vseh tkivih in razvojnih fazah. Tran

Inbreeding in epigenetika: koristni in škodljivi učinki

Inbreeding in epigenetika: koristni in škodljivi učinki

Predmeti Epigenetika Inbreeding Članek o dopisovanju Christiana Biémonda (Biémont, C. Inbreeding učinki v epigenetski dobi. Nature Rev. Genet. 11 , 234 (2010) 1 in članki (Charlesworth, D. & Willis, JH Genetika inbreeding depresije. Nature Rev 10 , 783–796 (2009) 2, 3, o katerem razpravlja, si zasluži nadaljnji dialog. Ti pri

Poti za kršitev in zaščito genetske zasebnosti

Poti za kršitev in zaščito genetske zasebnosti

Predmeti Objava in arhiviranje podatkov Sekvenciranje DNK Etika Genetske baze podatkov Izvirni članek je bil objavljen 8. maja 2014 Nature Reviews Genetics 15 , 409–421 (2014) V zgornjem članku je bila napačna navedba navedena v referenci 107. Navedba naj bi bila: Ayday, E., Raisaro, JL, McLaren, PJ, Fellay, J. &am

Ugodni prispevki v primerjavi z gensko arhitekturo

Ugodni prispevki v primerjavi z gensko arhitekturo

Predmeti Bolezni genetika Epidemiologija Genska variacija Študije povezav z genomi Dedne kvantitativne lastnosti Medicinska genomika Naslednje generacije Z zanimanjem beremo dopise Evansa in Kellerja (Uporaba metod delitvene dednosti za raziskovanje genske arhitekture. Nat Rev. Genet. //Doi.org/10.1038/nrg.

Nihanje hitrosti mutacije v evkariotih: evolucijske posledice mehanizmov, specifičnih za mesto

Nihanje hitrosti mutacije v evkariotih: evolucijske posledice mehanizmov, specifičnih za mesto

Recenzija Baerja in sod . "Različnost mutacije pri večceličnih evkariontih: vzroki in posledice" 1 natančno prikazuje tenor večine literature o evoluciji hitrosti mutacije. Čeprav prepoznamo, da se hitrost mutacij lahko močno razlikuje od mesta do mesta znotraj genoma, ta literatura večinoma ignorira ali minimizira posebne značilnosti in posledice mutacijskih mehanizmov, ki so značilni za mesto. Zato žel

Ocenjevanje in obvladovanje tveganja pri izmenjavi zbirnih podatkov genske variante

Ocenjevanje in obvladovanje tveganja pri izmenjavi zbirnih podatkov genske variante

Predmeti Genetske baze podatkov Genska variacija Študije povezav z genomi Prvotni članek je bil objavljen 16. septembra 2011 Nature Reviews Genetics 12 , 730–736 (2011) V zgornjem članku je bila za GWAS Central podana napačna povezava. Pravilna povezava bi morala biti //www.gwascentral.org. V polju z dodatnimi informacijami je bila povezava do //gwas.nih.g

Računalništvo v oblaku za analizo in sodelovanje genskih podatkov

Računalništvo v oblaku za analizo in sodelovanje genskih podatkov

Predmeti Računalniška biologija in bioinformatika Genetske baze podatkov Genomika Naslednje generacije Podatki raziskav Prvotni članek je bil objavljen 30. januarja 2018 Nature Reviews Genetics doi: 10.1038 / nrg.2017.113 (2018) Zgornji članek je prvotno navedel, da „FireCloud in CGC za računanje in shranjevanje podatkov zanašata AWS in Google Cloud Platform. Uporab

LCN DNK: dokaz brez razumnega dvoma? - odziv

LCN DNK: dokaz brez razumnega dvoma? - odziv

V članku McCartneyja (LCN DNA: dokaz brez razumnega dvoma? Nature Rev. Genet. 9 , 325 (2008)) 1 trdijo, da je sojenje v Omaghu pokazalo resne pomanjkljivosti v dokazih o DNK. Vendar pa veliko dokazov mediji niso poročali, prav tako niso zapisali v sami sodbi. Vloga znanstvenika je, da nepristransko svetuje o pomenu dokazov.

Izboljšanje človeške forenzike z napredkom genetike, genomike in molekularne biologije

Izboljšanje človeške forenzike z napredkom genetike, genomike in molekularne biologije

Predmeti Bioinformatika Genomika raka Etika Genetske tehnike Genomika Molekularna biologija Družbene vede Tehnologija Prvotni članek je bil objavljen 18. februarja 2011 Nature Reviews Genetics 12 , 179–192 (2011) Na sliki 3 tega članka je bil rdeči okvir okoli drugega, tretjega in četrtega očesa v tretjem stolpcu nepravilno nameščen. Škatla n

Empirični testi za kompozicijsko epistazo

Empirični testi za kompozicijsko epistazo

Predmeti Genska interakcija Genska variacija Statistične metode Cordell je v svojem recenzijskem članku (Odkrivanje interakcij genov in genov, ki so temelj človeških bolezni. Nature Rev. Genet. 10 , 392–404 (2009) 1 ) in drugje 2 , trdila, da so statistični testi za interakcije v omejeni uporabi za razjasnitev epistaze pri bolj biološki smisel izraza - to je, ko učinek določene genetske variante prikrije varianta na drugem mestu 3, 4 („kompozicijska epistaza“ 5 ). Predpostavim

Obravnavanje postopkov specifikacije kot kompleksnih lastnosti

Obravnavanje postopkov specifikacije kot kompleksnih lastnosti

V polju 4 svojega pregleda 1 sta Noor in Feder navedla deset primerov genov, ki sodelujejo pri oblikovanju reproduktivne ovire, kar bi lahko privedlo do dogodkov v specifikaciji. Avtorji so zapisali: "... lahko bi nas v prihodnosti presenetilo, ker se preslikava več ovir in dokaže, da vključujejo mehanizme, kot sta mejotski nagon ali genomski konflikt v večji meri, kot je trenutno cenjeno" (str. 85

Preskusi združitve za redke različice: mutacija kontrolnega primera

Preskusi združitve za redke različice: mutacija kontrolnega primera

Predmeti Rak genetika Gensko testiranje Študije povezav z genomi Redke variante Dva nedavna pregleda, ena v reviji Nature Reviews Genetics od Bansal et al . (Strateške statistične analize za asociacijske študije, ki vključujejo redke različice. Nature Rev. Genet. 11 , 773–785 (2010) 1 in drugje 2 , so preučile nastajajoče področje študij asociacije redkih variant. Ti pregled

Odgovor: O vrednosti analize genotipa-fenotipa na osnovi haplotipa in o transformaciji podatkov v farmakogenetiki in -genomiji

Odgovor: O vrednosti analize genotipa-fenotipa na osnovi haplotipa in o transformaciji podatkov v farmakogenetiki in -genomiji

Pozdravljam komentarje Vormfeldeja in Brockmöllerja, za katera v svojem uvodnem članku ne mislim, da mi povsem nasprotujejo, ampak da grem dlje, kot sem imel. Vendar bi želel predstaviti več opozoril na njihova opažanja. Analize haplotipov lahko pogosto prinesejo prednosti pred analizo enega SNP naenkrat, zlasti kadar, kot sem že zapisal na strani 787 mojega pregleda 1 , obstaja več, tesno povezanih funkcionalnih različic, ki delujejo na cis . Vendar