Polimorfizmi in haplotipi v tlr9 in myd88 so povezani z razvojem hodgkinovega limfoma: študija o povezavi kandidat-gen | časopis za človeško genetiko

Polimorfizmi in haplotipi v tlr9 in myd88 so povezani z razvojem hodgkinovega limfoma: študija o povezavi kandidat-gen | časopis za človeško genetiko

Anonim

Izvleček

Cestno podobni receptorji (TLR) in polimorfizmi gena primarnega odziva 88 (MYD88) za mieloidno diferenciacijo so lahko vključeni v patogenezo Hodgkinovega limfoma (HL) s spremenjenimi imunoregulacijskimi in vnetnimi odzivi. Za raziskavo povezave med polimorfizmi genov TLR9 −1237T> C, TLR9 2848A> G, MYD88 −938C> A in MYD88 1944C> G ter tveganjem za HL je bila izvedena študija povezave med kandidati in geni. Pregledali so tudi vpliv haplotipov. Študija je pokazala, da je prevoz vozil za –1237C in 2848A povezan s povečanim tveganjem za HL (razmerje kvot (OR) = 2, 53 (1, 36–4, 71) in OR = 6, 20 (1, 3–28, 8)). Polimorfizmi MYD88 so dali nepomembne rezultate. Ocenjene frekvence haplotipov TLR9 / 1237C-2848A in MYD88 / 938C-1944G so se tudi med HL in kontrolo bistveno razlikovale ( P <0, 01). Poleg tega je bila za haplotipe TLR9 / 1237C-TLR9 / 2848A-MYD88 / 938C-MYD88 / 1944C opažena pomembna razlika med HL in kontrolami ( P <0, 01). Na koncu je naša raziskava pokazala, da so polimorfizmi TLR in haplotipi TLR9 in MYD88 povezani z razvojem HL.

Uvod

Hodgkinov limfom (HL) je občasna neoplazma s starostjo prilagojeno incidenco 2, 5-3, 1 na 10E5 v zahodnem svetu. 1, 2 Vmešane bezgavke kažejo vnetno celično ozadje in redke celice Reed Sternberga (RS), ki so maligne celice HL. Patogeneza HL ostaja nejasna. Transkripcijski faktor, ki je bil vpleten v patogenezo HL, je jedrski faktor-κB (NF-κB), pleiotropni mediator vnetja. Močna konstitutivna aktivnost NF-κB je skupna značilnost HL celičnih linij 3 in je potrebna za širjenje in preživetje RS celic. 3 Vendar vzrok za sprožitev NF-kB še vedno ni mogoč, vendar obstajajo dokazi, da je morda povezan z virusom herpesa Epstein (EBV), herpes virusom, ki je povezan s HL. 4, 5, 6, 7, 8, 9 Poleg tega eden od EBV proteinov, latentna membranska beljakovina 1 (LMP1), aktivira NF-κB, spodbuja razmnoževanje celic in preprečuje apoptozo. 10

Družinske študije so pokazale, da lahko podedovani dejavniki igrajo tudi vlogo pri razvoju HL; pri osebah, povezanih s bolniki s HL, je več kot trikrat povečano tveganje za razvoj HL, kar kažejo študije populacij 11, 12, 13, 14, 15 in dvojčka. 16 Dejavniki, ki sodelujejo pri prepoznavanju EBV in aktivaciji NF-kB, so cestninski receptorji (TLR). Konkretno, TLR9 prepozna virusne otoke CpG in ko se aktivira, signalizira prek proteina 88 mieloidne diferenciacije primarni odziv (MYD88) in vodi do aktivacije NF-κB. 17, 18, 19 Glede na pomen TLR-jev pri aktivaciji NF-κB bi lahko postavili hipotezo, da imajo lahko ti receptorji vlogo v obilnem vnetnem ozadju, prisotnem pri HL. Za testiranje te hipoteze smo izbrali, da preučimo, ali so genetske razlike v TLR9 in MYD88 povezane z razvojem HL. Prejšnje študije pri HL 20 so pokazale, da je razmerje med kvotami (OR) 0, 82 za TLR9 -1237C, ki ima mejni pomen, medtem ko so bile ugotovljene šibke povezave tudi za folikularni limfom in kronično limfocitno levkemijo.

TLR9 se nahaja na kromosomu 3p21.3; 21 sestavljata ga dva eksona in dva eno-nukleotidna polimorfizma (SNP-ji) opredeljujeta štiri najpogostejše haplotipe pri belcih. 22 Sem spadajo −1237T> C (dbSNP rs5743836) in sinonimni 2848A> G (P545P) (dbSNP rs352140) SNP, ki se nahaja v eksonu 2. TLR9 je v neposredni bližini gena MYD88, ki se nahaja na kromosomu 3p22 in je sestavljen iz pet eksonov. 23 SNP −938C> A (dbSNP rs4988453) in 1944C> G (dbSNP rs4988457) opredeljujeta dva najpogostejša haplotipa pri belcih. 24 V tej analizi smo se lotili študije združenja genskega kandidata, da bi raziskali, ali omenjeni polimorfizmi prispevajo k tveganju za nastanek HL.

Rezultati

Demografske značilnosti študentske populacije

V tej študiji je bilo analiziranih 91 primerov in 92 kontrol. Povprečna starost (± sd) je bila 42, 9 ± 18, 5 in 35, 5 ± 10, 1 leta za primere in kontrole; V skupini primerov je bilo 44 (50, 6%) moških in 43 (49, 4%) žensk, kontrolna skupina pa 27 (29, 3%) in 65 (70, 7) žensk. HL vzorci so bili naslednjih histoloških podtipov: nodularna skleroza (73 primerov), mešana celična (15 primerov) in bogata z limfociti (3 primeri). Kontrolni subjekti so bili mlajši in so sestavljali večji odstotek žensk kot primeri.

Distribucije genotipov in kakovost študija

Porazdelitve genotipov TLR9 -1237T> C, TLR9 2848A> G, MYD88 -938C> A in MYD88 1944C> G v obeh primerih in kontrolnih skupinah so prikazane v tabeli 1. Zaznane so bile bistvene razlike pri porazdelitvi genotipov obeh TLR polimorfizmi med primeri in kontrolami ( P = 0, 01 za TLR9 -1237T> C in P = 0, 03 za TLR9 2848A> G). Nasprotno pa za polimorfizme MYD88 ni bilo razlik ( P = 0, 16 za MYD88 -938C> A in P = 0, 25 za MYD88 1944C> G). Pri polimorfizmih MYD88 ni bilo nobenih posameznikov, ki so bili homozigotni za mutantni alel v obeh primerih ali v kontroli.

Tabela polne velikosti

Kontrole so bile v HW ravnotežju za vse raziskane polimorfizme, kar kaže na pomanjkanje stratifikacije in / ali napake v genotipizaciji 28 ( P = 0, 11 za TLR9 -1237T> C, P = 0, 37 za TLR9 2848A> G, P = 0, 99 za MYD88 -938C> A in P = 0, 60 za MYD88 1944C> G).

Polimorfizmi v TLR9 in povezava s HL

Tabela 2 prikazuje rezultate povezave za polimorfizme TLR9 . Kontrast alel je pokazal, da je za alel −1237C obstajalo dvakratno tveganje za HL glede na alel −1237T (OR = 1, 99 (1, 18–3, 36)). Poleg tega so bili pri osebah, ki so prenašali −1237C, večje tveganje za neprilagojeno HL in prilagojeno glede na starost in spol (OR = 2, 53 (1, 36–4, 71) in OR = 2, 02 (1, 04–3, 89).

Tabela polne velikosti

Glede polimorfizma TLR9 2848A> G je alelni kontrast ustvaril mejno povezavo (OR = 1, 54 (1, 00–2, 39)). 2848A prevozniki so imeli povečano tveganje za HL, saj je bil neprilagojeni OR pomemben (OR = 6, 20 (1, 3–28, 8)); vendar je bil prilagojeni ALI mejno pomemben (OR = 4, 66 (1, 00–22, 9)).

Polimorfizmi v genu MYD88 in povezava s HL

Tabela 2 kaže, da so polimorfizmi MYD88 dali nepomembne rezultate. Kontroli alelov –938C proti A in 1944G proti C niso bili pomembni (OR = 1, 77 (0, 75–4, 16) in OR = 1, 40 (0, 77–2, 56)). Poleg tega prevozniki 1944G niso bili povezani s povečanim tveganjem za HL (neprilagojeni OR = 1, 47 (0, 76–2, 84) in prilagojeni OR = 1, 38 (0, 68–2, 78)).

Pogostnost haplotipa TLR9 in MYD88 pri bolnikih s HL in kontrolnih osebah

Tabela 3 prikazuje vrednosti P in ustrezni D 'in r 2 za testiranje neravnovesja povezav med pari SNP za bolnike s HL in kontrol. V populaciji bolnikov je bil TLR9 -1237T> C v motnji povezave s TLR9 2848A> G ( P <0, 01), MYD88 -938C> A ( P = 0, 04) in MYD88 1944C> G ( P = 0, 05). TLR9 2848A> G smo ugotovili tudi v neravnovesju vezi z MYD88 −938C> A ( P <0, 01) pri bolnikih s HL. Pri kontrolah sta bila dva polimorfizma MYD88 v neravnovesju vezi ( P <0, 01) (tabela 3).

Tabela polne velikosti

Porazdelitev ocenjene frekvence haplotipa dveh polimorfizmov TLR9 in dveh polimorfizmov MYD88 za HL in kontrolne skupine je predstavljena v preglednici 4. Glede haplotipov TLR9 je obstajala splošna pomembna razlika med HL in kontrolami ( P = 0, 03). Ta razlika je nastala zaradi haplotipa 1237C-2848A (ali haplotipa 1237T-2848G) ( P <0, 01). Za haplotipe MYD88 skupna razlika ni bila pomembna ( P = 0, 20). Vendar je bila ocenjena pogostost haplotipa 938C-1944G v HL in kontrolnih skupinah različna; ta razlika je lahko posledica neravnovesja povezave s polimorfizmi TLR9 ali zaradi interakcije med obema polimorfizmom, glede na to, da posamezni polimorfizmi MYD88 niso bili pomembni.

Tabela polne velikosti

Ko smo upoštevali ocenjene haplotipe štirih preiskovanih polimorfizmov (tabela 5), ​​smo opazili znatno razliko med HL in kontrolami za haplotipe 1237T-2848G-938C-1944C in 1237C-2848A-938C-1944C ( P <0, 01), nadalje nakazuje povezavo alelov 1237T in 2848G (ali alelov nosilcev) z občutljivostjo za HL.

Tabela polne velikosti

Diskusija

Ta študija je preučila, ali so nekateri polimorfizmi genov TLR9 in MYD88 povezani z razvojem HL. Naši rezultati so pokazali, da alel TLR9 -1237C predstavlja dvakrat povečano tveganje za HL in da je alel TLR9 2848A povečal tveganje za HL za ∼ 4, 5-krat v proučevani populaciji kavkaške države. Za nobeno analizirano SNP MYD88 (MYD88 −938C> A in MYD88 1944C> G) ni bilo ugotovljeno, da bi spremenil občutljivost za HL. Vse porazdeljene genotipe preučenih SNP so bile v kontrolni skupini v HW, kar ne kaže na populacijsko stratifikacijo. Analiza haplotipov je tudi pokazala, da je bila porazdelitev haplotipov TLR9 1237C-2848A med primeri in kontrolo različna.

Drugi so prav tako preučili vlogo TLR in zlasti polimorfizmov genov TLR9 pri dovzetnosti za človeške bolezni, povezane s spremenjenimi imunskimi odzivi in ​​vnetji. Med drugimi polimorfizmi TLR, Nieters et al. 20 raziskovalo prispevek SNP TLR9 −1486T> C in −1237T> C k razvoju limfomov, vključno s 115 primeri HL. 20-odstotno zmanjšano tveganje za vse limfome je bilo povezano z alelom TLR9 -1237C, vendar je to imelo mejni pomen. V nasprotju z našo raziskavo ni bil najden prispevek SNP −1237T> C k HL.

Čeprav so bile v naši raziskavi odkrite pomembne povezave, je bila velikost sorazmerno majhna. Vendar pa študije združenja kandidatov in genov ponavadi nimajo moči za zaznavanje statistično pomembne povezave. Na primer, da bi dosegli moč> 80%, da bi prepoznali skromen genetski učinek (OR = 1, 2) polimorfizma, ki je prisoten pri 10% posameznikov, bi bilo potrebno vzorec velikosti 10 000 oseb. 28 Zato morajo biti velikosti vzorcev, ki so potrebne za napovedovanje povezanosti, daleč presegajo trenutno razpoložljivo in nobena sama ustanova ali subjekt ne bo mogel zagotoviti ustreznega števila bolnikov. Toda prihodnja metaanaliza več študij ima očitno vlogo pri ponujanju analize s potencialom za večjo moč. 28, 29 Prihodnje kolaborativne študije lahko omogočijo združevanje podatkov in zagotovijo več moči za zaznavanje pomembnih povezav. Poleg tega bodo konzorciji, ki izvajajo študije za povezavo z genskim kandidatom ali za genom, lahko ponovili veljavnost teh ugotovitev.

Ta študija je temeljila na hipotezi, da lahko genetske razlike v TLR9 in MYD88 , ki imata ključno vlogo pri imunosti in vnetju, lahko spremenita imunološke odzive na nižji stopnji po aktivaciji NF-κB. Glede na to, da je povečana aktivacija NF-κB značilna za celične linije HL in je potrebna za proliferacijo in preživetje RS celic, bi lahko spremenljivost ekspresije 3 TLR sodelovala v patogenezi HL. To hipotezo je nadalje podkrepilo dejstvo, da je EBV večkrat povezan z razvojem HL in da ob okužbi z EBV LMP1 konstitutivno oddaja signale, ki aktivirajo NF-κB. 10

Zaenkrat se zdi funkcionalna vloga polimorfizma TLR9 -1237T> C kontroverzna. Delecije, ki segajo do promocijskega območja od –3, 2 do –0, 7 kb, niso spremenile aktivnosti promotorja TLR930 , čeprav se je izkazalo, da je regija pomembna za zaviranje ekspresije TLR9 s človeškim papiloma virusom . 31 V silikonski analizi promotorja TLR9 je bilo razvidno, da sprememba −1237T> C uvaja domnevno vezavno mesto transkripcijskega faktorja c-Rel / NF-κB; 32 in vitro poročevalskih testov je pokazalo, da SNL TLR9 -1237T> C spremeni aktivnost promotorja TLR9 , pri čemer ima alel −1237T višjo promocijsko aktivnost ( P = 0, 018), kar kaže na obstoj regulatornih elementov na polimorfnem mestu 33 in pomeni da je alel −1237C povezan z nižjimi nivoji izražanja TLR9 .

V zaključku je ta študija pokazala, da lahko genetska variacija TLR9 spremeni občutljivost za HL. Čeprav funkcionalni pomen SNP-ja TLR9 -1237T> C in TLR9 2848A> G še vedno ni treba razjasniti, naši rezultati kažejo, da so polimorfizmi TLR9 ter haplotipi TLR9 in MYD88 lahko vključeni v patogenezo HL.

Pridružitve

GenBank / EMBL / DDBJ

  • NM_002468
  • NM_017442