Metod (Marec 2020)

Hitro, natančno odpravljanje napak na piklih posledic amplikona z uporabo akacije

Hitro, natančno odpravljanje napak na piklih posledic amplikona z uporabo akacije

Predmeti Bioinformatika Mikrobne skupnosti Zaporedje Uredniku: Meritve mikrobne raznolikosti, ki temeljijo na zaporedju amplikona z visokim pretokom, so ogrožene zaradi napak pri branju. Roche 454 GS FLX Titanove pirostrukcije so trenutno najpogosteje uporabljena tehnologija za raziskave mikrobiološke združbe, ki temeljijo na amplikonu, kljub visokim napakam napak pri vstavljanju in brisanju, povezanih s homopolimerom 1, 2 . T

Količinsko določanje lokalne ločljivosti zemljevidov krio-EM gostote

Količinsko določanje lokalne ločljivosti zemljevidov krio-EM gostote

Predmeti Krioelektronska mikroskopija Obdelava slik Beljakovine Programska oprema Izvleček Predlagamo opredelitev lokalne ločljivosti za tridimenzionalne elektronske krio-mikroskopske (krio-EM) zemljevide gostote, ki uporabljajo lokalne sinusoidne značilnosti. Naš algoritem nima prostih parametrov in je uporaben za druge načine slikanja, vključno s tomografijo. Z ov

Vizualizacija podatkov: dvoumnost kot sopotnik

Vizualizacija podatkov: dvoumnost kot sopotnik

Predmeti Bioinformatika Računalniška biologija in bioinformatika Biti prepričan je dobro; biti negotov ni nujno slabo. Raziskovalne skupine si prizadevajo, da bi negotovost postale vidne. Glavno Podatki iz poskusa se lahko zdijo trdni. Po nadaljnjem pregledu lahko podatki preidejo v nekaj veliko manj trdnega. O

ProteomeBinders: načrtovanje evropskega vira afinitetnih reagentov za analizo človeškega proteoma

ProteomeBinders: načrtovanje evropskega vira afinitetnih reagentov za analizo človeškega proteoma

Popravek tega članka je bil objavljen 1. februarja 2007 Ta članek je bil posodobljen ProteomeBinders je nov evropski konzorcij, katerega namen je vzpostaviti obsežen vir dobro značilnih afinitetnih reagentov, vključno s protitelesi, vendar ne omejeno nanje, za analizo človeškega proteoma. Glede na veliko raznolikost proteome je obseg projekta potencialno neizmeren, vendar kljub temu izvedljiv v okviru vseevropskega ali celo svetovnega usklajevanja. OPOMB

Dodatek: Raziskovanje določevalcev zaporedja amiloidne strukture z uporabo točkovalnih matric

Dodatek: Raziskovanje določevalcev zaporedja amiloidne strukture z uporabo točkovalnih matric

Predmeti Agregacija beljakovin Slednje beljakovin Proteome informatika Prvotni članek je bil objavljen 14. februarja 2010 Nat. Metode 7 , 237–242 (2010); objavljeno na spletu 14. februarja 2010; dodatek objavljen po tiskanju 29. septembra 2010. Po objavi našega prispevka smo v tabeli 1 ugotovili napako glede primerjave našega programa Waltz s programskim 3D profilom 1 (ref. 25

Plazmidi: nakupovanje v dobi obilja

Plazmidi: nakupovanje v dobi obilja

Predmeti Citološke tehnike Funkcionalna genomika Sončne celice Tehnologija Upravljanje, deljenje in nadzor kakovosti plazmidov je lahko preprosto. Vendar številne tehnike njihovega razširjanja ne dosegajo obsega, kar vodi v neprofitne organizacije in podjetja k iskanju novih možnosti. Glavno Obstaja veliko načinov "nakupovanja" plazmidov, ekstrahromosomske, krožne DNK, ki jo najdemo v bakterijah in nekaterih evkariontskih celicah. Plazm

Manjše ko je bolje

Manjše ko je bolje

Biologe vse bolj zanimajo eno-molekularni pristopi. V tej številki Focus ponuja biologin vodnik po tem relativno novem področju, dva prispevka pa predstavljata napredek v nanostusualni vizualizaciji. Za ogled in objavo komentarjev na ta članek obiščite metogoro . Sposobnost analiziranja bioloških sistemov na ravni eno molekule odpira možnosti raziskovanja, ki niso možne z uporabo tehnik, ki merijo agregatne lastnosti molekulskih populacij. Ta nov

Popravek: Natančna identifikacija eno-nukleotidnih variant v celicah, ojačenih s celim genomom

Popravek: Natančna identifikacija eno-nukleotidnih variant v celicah, ojačenih s celim genomom

Izvirni članek je bil objavljen 20. marca 2017 Nat. Metode 14 , 491–493 (2017); objavljeno na spletu 20. marca 2017; popravljeno po tisku 13. oktobra 2017 V različici tega članka, ki je bil prvotno objavljen, Lodato, MA in sod . Science 350 , 94–98 (2015) (referenca 2) je naveden kot primer študije o enoceličnem sekvenciranju z visokimi prehodi CG v TA, ki uporablja toplotno lizo. Vendar

Izdelki Thermo Scientific omogočajo vrhunsko uporabo matičnih celic

Izdelki Thermo Scientific omogočajo vrhunsko uporabo matičnih celic

Izvleček Portfelj Thermo Scientific Stem Cell Excellence vključuje številne izdelke, ki so ključnega pomena za uspešno raziskovanje matičnih celic. Izdelki v portfelju Stem Cell Excellence uporabljajo raziskovalce za podporo vrhunskih aplikacij v svetovnih laboratorijih po vsem svetu in zagotavljajo natančnost in zanesljivost, ki so potrebna za podporo tega prelomnega raziskovalnega področja. Tukaj

Mikroskopija: videnje skozi tkivo

Mikroskopija: videnje skozi tkivo

Predmeti Celična nevroznanost Fluorescenčno slikanje Tehnologija Vzorci tkiv razpršijo svetlobo in zaprejo globlji pogled. Sredstva za čiščenje tkiv so to spremenila, vendar morajo znanstveniki razmisliti o optimizaciji optike pri uporabi teh metod. Glavno Za preučevanje vzrokov srčnih napadov je nemški anatom Werner Spalteholz razvil način, da postane tkivo srca prozorno z mešanico benzilalkohola in metil salicilata. Na razsta

Popravek: Množično vzporedna mutageneza ene aminokisline

Popravek: Množično vzporedna mutageneza ene aminokisline

Izvirni članek je bil objavljen 5. januarja 2015 Nat. Metode 12 , 203–206 (2015); objavljeno na spletu 5. januarja 2015; popravljeno po tisku 10. aprila 2017 V prvotno objavljeni različici tega članka je bila enota (nM) za koncentracijo dUTP, opisana v razdelku »Priprava predloge za divje vrste« v spletnih metodah, napačna. Pravil

Inteligentno oblikovan odziv

Inteligentno oblikovan odziv

Znanstveniki so vse pogosteje pozvani, da razpravljajo o mitu o inteligentnem oblikovanju kot znanstveni teoriji. Za ogled in objavo komentarjev na ta članek obiščite metogoro . Nekaj ​​več kot leto dni, preden praznujemo dvestoletnico Darwinovega rojstva, je protitarvinski aktivizem živ in zdrav. Najbolj

Microfluidics: v iskanju morilske aplikacije

Microfluidics: v iskanju morilske aplikacije

Podjetja in akademski raziskovalci razvijajo vse več mikrofluidnih naprav. Toda tehnološke zainteresirane strani si resnično želijo, da bi to sprožilo široko sprejemanje mikrofluidike s strani biologov. Poroča Nathan Blow. Področje mikrofluidike je zdaj na mestu, ko se išče iskanje za "aplikacijo za morilce" - ali "aplikacijo za morilce", kot bi rekli računalniški ljudje. V zadnjih

Majhne RNK: novi pogum biologije

Majhne RNK: novi pogum biologije

Majhna prizadevanja za odkrivanje in profiliranje RNK dramatično preoblikujejo temeljne koncepte regulacije genov in vodijo do novih orodij za preučevanje delovanja genov. Sposobnost dvoverižne RNA, da utiša gene, je bila prvič opisana v Caenorhabditis elegans leta 1998 - odkritje, ki bi si Andrew Fire in Craig Mello zaslužilo Nobelovo nagrado za fiziologijo ali medicino za leto 2006. Naše

Vrtanje v velike podatke o genomu raka

Vrtanje v velike podatke o genomu raka

Predmeti Bioinformatika Genomika raka Tlakovanje cest skozi podatkovne gore, konzorciji razvijajo delovne procese in orodja za široko uporabo. Glavno Rak genetik Matthew Meyerson, ki je na Inštitutu za rak Dana-Farber in na širokem inštitutu MIT in Harvarda, spremlja številne načine, kako tumorji povzročajo kaos v urejenih celicah. V svo

Hitra in visoko zmogljiva knjižnična priprava za zaporedje naslednje generacije

Hitra in visoko zmogljiva knjižnična priprava za zaporedje naslednje generacije

Predmeti Kemijske knjižnice Naslednje generacije Izvleček Napredek pri zaporedju naslednje generacije je privedel do novih metod priprave knjižnice, združljivih z več platformami za zaporedje. Trenutne metode (tako mehanske kot encimske) se soočajo z omejitvami: večstopenjski protokoli, izguba vzorca, pomanjkanje avtomatizacije in stroški dela. S stal

Mikrobiologija: najboljša pristranskost PCR

Mikrobiologija: najboljša pristranskost PCR

Predmeti Metagenomika Mikrobiom Tehnike, ki temeljijo na PCR Rezultati dejavnikov razširjene tehnike za analizo mikrobiomov lahko prekrivajo številne dejavnike, vendar raziskovalci iščejo strategije, kako doseči resnico. Glavno Predstavljajte si, da se držite viale vode, ki se plazi z mikrobi - in to je dobro, ker izvajate popis številnih mikroskopskih prebivalcev jezera, iz katerih ste dobili to vodo. Toda

Majhna dihalna pot na čipu omogoča analizo vnetja pljuč pri ljudeh in odzivov na zdravila in vitro

Majhna dihalna pot na čipu omogoča analizo vnetja pljuč pri ljudeh in odzivov na zdravila in vitro

Predmeti Citokini Lab-on-a-chip Dihanje Prevajalske raziskave Izvleček Tu opisujemo razvoj človeškega pljučnega "majhnega dihalnega sistema na čipu", ki vsebuje diferenciran, mukocilijarni bronhiolarni epitelij in osnovni mikrovaskularni endotel, ki ima tekočinski pretok, kar omogoča in vitro analizo patofiziologije pljučnega nivoja na organu. Izpost

Mera obnovljivosti

Mera obnovljivosti

Predmeti Biološke tehnike Podatki raziskav Jasna ideja o uspešnosti bioloških raziskovalnih metod - in prednosti, pa tudi meje - je ključnega pomena za pridobivanje zanesljivih podatkov, ki jih drugi lahko reproducirajo. Sposobnost ponovitve in nadgradnje dela drugih znanstvenikov ali prilagajanje zamisli, kadar podatki nakazujejo drugače, je del temeljne podpore znanstvenega procesa. A g

Kje so podatki?

Kje so podatki?

Predmeti Založništvo Nature Methods zdaj zahteva, da se izjave o razpoložljivosti podatkov priložijo raziskovalnim prispevkom. Ko raziskovalna skupnost vključuje izmenjavo podatkov, lahko akademske revije pomagajo. Od tega meseca bodo morali vsi raziskovalni članki, sprejeti za objavo v Nature , Nature Methods in 11 drugih Nature naslovih, vsebovati informacije o tem, ali in kako lahko bralci dostopajo do osnovnih podatkov. Te i

Označevanje nenamernega proteome in vivo

Označevanje nenamernega proteome in vivo

Predmeti Proteome Proteomska analiza Proteomics Alvarez-Castelao, B. et al . Nat. Biotehnol. 35 , 1196–1201 (2017). Metode za označevanje na novo sintetiziranih beljakovin omogočajo raziskovalcem, da lovijo beljakovine iz celic za identifikacijo s pomočjo tehnik, kot je masna spektrometrija. Sistem mutirane metionio-tRNA sintetaze (MetRS) omogoča, da se metionin tRNA napolni z nenaravnim analognim aminokislinam azidonorleucinom, ki vsebuje bioorthogonalni del, ki ga je mogoče s kemijo klikniti s čistilnim ročajem. S kombi

Popravek: Primerjalna vizualizacija odnosov genotip-fenotip

Popravek: Primerjalna vizualizacija odnosov genotip-fenotip

Izvirni članek je bil objavljen 30. julija 2015 Nat. Metode 12 , 698–699 (2015); objavljeno na spletu 30. julija 2015; popravljeno po natisu 24. septembra 2015 V prvotno objavljeni različici tega članka je bil vir financiranja izpuščen. Avtorji priznavajo dodatno financiranje s strani Medicinskega sveta za raziskave (program MC_U142684171). Napak

Shranjevanje DNK in RNK v suhem stanju

Shranjevanje DNK in RNK v suhem stanju

Izvleček Voda skrajša rok trajanja DNK. Celovitost biosampa je vprašljiva za vzorce, ki se hranijo v vlažnem okolju zaradi obstojne nevarnosti hidrolize DNK, tudi pri nizki temperaturi. GenVault je razvil nabor izdelkov, ki vključuje GenPlates ™, GenSolve ™, GenTegra ™ epruvete in GenConnect ™ za shranjevanje in upravljanje bioloških vzorcev na suhem in pri sobni temperaturi (25 ° C). GenVault preu

Masna spektrometrija: igra dohitevanja

Masna spektrometrija: igra dohitevanja

Masna spektrometrija je bolj kot kdaj koli prej v ospredju funkcionalnih raziskav proteomike. Tehnologija je že daleč, a kaj čaka prihodnost? Nathan Blow dobiva perspektive, napovedi in želje ključnih razvijalcev. "V zadnjem desetletju smo videli predvsem izboljšave obstoječih tehnologij, " pravi Franz Hillenkamp z univerze v Munsteru. John

"Grobi vodnik" za objavo

"Grobi vodnik" za objavo

Predložitev ali ponovno pošiljanje rokopisa - nekaj pomembnih korakov in odločitev na poti. Za ogled in objavo komentarjev na ta članek obiščite metogoro . Pot do objave je za nekatere znanstvenike dobro prebita, za druge pa bolj kot temna, neoznačena pot. Pomaga vedeti, kaj lahko pričakujemo od strokovnega pregleda (glej uvodnik iz maja 2006), vendar tudi številni drugi postopkovni koraki pogosto povzročajo dezorijentacijo. Tukaj je

Masna spektrometrija za biologe

Masna spektrometrija za biologe

Predmeti Masena spektrometrija Proteomics Masovna spektrometrija, ki temelji na proteomiki, se še vedno hitro širi, ne samo z vidika metod in instrumentov, temveč tudi z bioloških vprašanj. Carol Robinson je prvič uporabila masni spektrometer kot najstnica v zgodnjih 70. letih. Spominja se visokih napetosti, nevarnosti in vznemirjenja. &quo

Viri variacije

Viri variacije

Predmeti Podatki raziskav Statistične metode Izvleček Za posplošitev zaključkov na populacijo moramo vzorčiti njeno variacijo. Glavno Spremenljivost je neizogibna pri poskusih zaradi bioloških in tehničnih učinkov. Medtem ko bi bilo treba tehnične spremenljivosti strogo nadzorovati, da bi izboljšali notranjo veljavnost rezultatov, je treba ohraniti nekatere vrste biološke spremenljivosti, da bi omogočili posplošitev rezultatov za populacijo, ki nas zanima. Eksperiment

Humanizirana fenotipska presejalna platforma za kronično bolečino

Humanizirana fenotipska presejalna platforma za kronično bolečino

Predmeti Kronična bolečina Fenotipsko presejanje Izvleček Censo Biotechnologies in Cellectricon sta združila moči, da bi razvili prvovrstno humanizirano platformo za odkrivanje drog, s katero bi se usmerili v kronično bolečino. Platforma temelji na pluripotentnih nevronih, pridobljenih iz matičnih celic, ki jih povzroča človek v kombinaciji s presejalnim sistemom Cellectricon Cellaxess ® Elektra. Kombinaci

Strukturna genomika v središču pozornosti

Strukturna genomika v središču pozornosti

Strukturna prizadevanja genomike so spodbudila nadaljnji razvoj novih metod in tehnologij, kar je koristilo široki skupnosti. Za ogled in objavo komentarjev na ta članek obiščite metogoro . Eno od mnogih področij raziskav, ki so se začele pri projektih na genomih, je področje, imenovano strukturna genomika, visoko prizadevanje za reševanje tridimenzionalnih beljakovinskih struktur. Trenut

Napaka: imunoPET za celo telo razkriva aktivno dinamiko SIV v makakih, ki se zdravijo z viremičnimi in protiretrovirusnimi terapijami

Napaka: imunoPET za celo telo razkriva aktivno dinamiko SIV v makakih, ki se zdravijo z viremičnimi in protiretrovirusnimi terapijami

Izvirni članek je bil objavljen 9. marca 2015 Nat. Metode 12 , 427–432 (2015); objavljeno na spletu 9. marca 2015; popravljeno po tisku 11. junija 2015 V prvotno objavljeni različici tega članka je bilo ime Emmeline L. Blanchard napačno napisano kot Emeline. Napaka je bila odpravljena v različicah članka HTML in PDF. Avtorj

Akademsko presejanje je zelo uspešno

Akademsko presejanje je zelo uspešno

Predmeti Poslovanje in industrija Pregledi z visoko prepustnostjo Znanstvena skupnost Ustvarjanje učinkovitih zaslonov zahteva čas, skepticizem in pronicljive kompromise. Raziskovalci v akademskih presejalnih centrih ustvarjajo analize za projekte, ki se jih velika farmacevtska podjetja neradi dotikajo.

Objektivna primerjava metod sledenja delcev

Objektivna primerjava metod sledenja delcev

Predmeti Fluorescenčno slikanje Obdelava slik Mikroskopija Izvleček Sledenje delcev je ključnega pomena za kvantitativno analizo medceličnih dinamičnih procesov iz slikovnih podatkov mikroskopske faze. Ker ročno odkrivanje in spremljanje velikega števila posameznih delcev ni izvedljivo, so za te naloge številne skupine razvile avtomatizirane računske metode. Z namen

Distribucija vzorčenja in zagonska vrvica

Distribucija vzorčenja in zagonska vrvica

Predmeti Podatki raziskav Izvleček Prtljažni pas se lahko uporablja za oceno negotovosti ocen vzorcev. Glavno Prej smo razpravljali o pomembnosti ocene negotovosti pri naših meritvah in jo vključili v analizo podatkov 1 . Da bi vedeli, v kolikšni meri lahko posplošimo svoja opažanja, moramo vedeti, kako se naša ocena razlikuje med vzorci in ali je pristranska (sistematično pretirana ali podcenjujejo resnično vrednost). Na žalos

Torej pišete prispevek

Torej pišete prispevek

Predmeti Založništvo Pisanje jasnega, natančnega in prepričljivega znanstvenega prispevka je hkrati umetnost in spretnost. To je vredno dobro obvladati. V sedemnajstem stoletju, zgodaj v zgodovini sodobne eksperimentalne znanosti, so bila odkritja običajno razširjena le v izbrani skupini (S. Shapin, Socialna zgodovina resnice , Univ. Chic

Študija vzorčnega vzorca HUPO razkriva pogoste težave v proteomiki, ki temelji na masni spektrometriji

Študija vzorčnega vzorca HUPO razkriva pogoste težave v proteomiki, ki temelji na masni spektrometriji

Popravek tega članka je bil objavljen 1. julija 2009 Ta članek je bil posodobljen Izvleček Izvedli smo študijo preskusnega vzorca, da bi v tekoči kromatografiji in masni spektrometriji, ki temelji na masni spektrometriji, poskušali ugotoviti napake, ki vodijo do neraznovljivosti, vključno z nepopolnostjo vzorčenja peptidov. V 27 l

Pregledi: starost rib

Pregledi: starost rib

Predmeti Slikanje Mikrofluidiki Pregledi Zebrafish Napredek mikrofluidike in slikanja v kombinaciji z nekaterimi odmevnimi študijami povečuje zanimanje za pregledovanje celotnega organizma. Randall Peterson ni vstopil v podiplomsko šolo za načrtovanje dela z zebra. Namesto tega je skušal razumeti, kako imunosupresivno zdravilo rapamicin vzajemno deluje z mTOR, njegovo ciljno proteinsko sesalko, za katero je zdaj znano, da vključuje celične signalne poti, ki nadzorujejo vse, od mobilnosti celic do sinteze beljakovin. V mes

Popravek: Izkoriščanje terciarne strukture skozi lokalne gube za kristalografsko fazo

Popravek: Izkoriščanje terciarne strukture skozi lokalne gube za kristalografsko fazo

Izvirni članek je bil objavljen 15. septembra 2013 Nat. Metode 10 , 1099–1101 (2013); objavljeno na spletu 15. septembra 2013; popravljeno po tisku 5. maja 2014 V prvotno objavljeni različici avtorja niso priznali vseh ljudi, ki so sodelovali pri ustvarjanju kristalografskih podatkovnih zbirk AF1503 iz A. fu

Imunološki testi AlphaLISA: alternativa neuporabnim ELISA za raziskave in odkrivanje zdravil

Imunološki testi AlphaLISA: alternativa neuporabnim ELISA za raziskave in odkrivanje zdravil

Izvleček PerkinElmer-ov imunski test AlphaLISA ® na kroglice je zasnovan za odkrivanje analitov v bioloških vzorcih. Ti kemiluminescentni testi brez umivanja so idealni za miniaturizacijo in avtomatizacijo. Imajo izjemno občutljivost, širok dinamični razpon in robustne zmogljivosti, ki so v primerjavi z običajnim imunsko absorbcijskim testom (ELISA) običajni. Glavno

Proteinski inženiring: krmarjenje med priložnostjo in razumom

Proteinski inženiring: krmarjenje med priložnostjo in razumom

Predmeti Kemijske knjižnice Proteinski inženiring Raziskovalci uporabljajo velike knjižnice, osredotočene knjižnice in racionalno zasnovo, da oblikujejo koristne beljakovine. Proteinski inženiring je bil uporabljen za ustvarjanje protiteles, zelo svetlih fluorescentnih beljakovin in encimov, ki posegajo po strupenih odpadkih. Zdra

Optimiziran način priprave knjižnice za zaporedje naslednjih generacij

Optimiziran način priprave knjižnice za zaporedje naslednjih generacij

Izvleček Pojav zaporedja naslednje generacije je omogočil analizo genom v prej nedosegljivi globini. Roche, Illumina in Life Technologies so med drugim razvili dobro uveljavljene platforme za globoko zaporedje. Ne glede na instrument je eno od ozkih grl za zaporedje naslednje generacije količina časa in sredstev, potrebnih za pripravo predloge in knjižnice. Tu

Kritična ocena razlage metagenome - merilo programske opreme za metagenomijo

Kritična ocena razlage metagenome - merilo programske opreme za metagenomijo

Predmeti Razvrstitev in taksonomija Računalniška biologija in bioinformatika Metagenomika Izvleček Metode za sestavljanje, taksonomsko profiliranje in binning so ključne za razlago metagenomskih podatkov, vendar pomanjkanje soglasja o primerjalnem vrednotenju otežuje oceno uspešnosti. Izziv Kritična ocena razlage metagenome (CAMI) je angažiral svetovno skupnost razvijalcev, da je svoje programe primerjala na zelo zapletenih in realističnih naborih podatkov, ustvarjenih iz newly 700 na novo sekvenciranih mikroorganizmov in novel 600 novih virusov in plazmidov ter predstavljajo skupne eksperiment

Napaka: sledenje strukturne dinamike beljakovin v raztopini z uporabo časovno ločljivega širokokotnega rentgenskega sipanja

Napaka: sledenje strukturne dinamike beljakovin v raztopini z uporabo časovno ločljivega širokokotnega rentgenskega sipanja

Prvotni članek je bil objavljen 21. septembra 2008 Nat. Metode 5 , 881–886 (2008); objavljeno na spletu 21. septembra 2008; popravljeno po natisu 29. septembra 2008. V prvotno objavljeni različici članka je časovna lestvica, navedena v legendi Slika 2d, napačna. Pravilna časovna lestvica naj bo 3 μs. Poleg t

Matične celice: modeli bolezni, ki kažejo in pripovedujejo

Matične celice: modeli bolezni, ki kažejo in pripovedujejo

Predmeti Celična kultura Ciljanje genov Inducirane pluripotentne matične celice Reporterski geni Znanstvena skupnost Stebelna celica Izvleček Kombiniranje tehnik urejanja genov z induciranimi pluripotentnimi matičnimi celicami je hkrati močno in zapleteno. Glavno Celice so izgledale čudovito - in to je bila slaba novica, se spominja Clive Svendsen, raziskovalec matičnih celic in nevrobiolog v medicinskem centru Cedars-Sinai. Razvi

Osredotočite se na Mapiranje možganov

Osredotočite se na Mapiranje možganov

Predmeti Slikanje Nevroznanost Vizualizacija funkcionalne povezljivosti možganske možganske skorje na podlagi podatkov magnetne resonance. Podoba možganov Joachima Böttgerja in Daniela Marguliesa (Inštitut Max Planck za človekove kognitivne in možganske vede, Leipzig, Nemčija) s pomočjo skladatelja Tobiasa S. Hoffman

Masena spektrometrija za kromatinsko biologijo

Masena spektrometrija za kromatinsko biologijo

Predmeti Kromatin Analiza histona Masena spektrometrija Da bi odkrili nove znake histona in interakcije, se raziskovalci obrnejo na prefinjene instrumente proteomike. Glavno Preiskovalci, ki nameravajo zlomiti eno kodo, lahko drugo spregledajo. Torej, v dneh, ko se verjame, da ima samo zaporedje DNK vse celične skrivnosti, so histoni, beljakovinska jedra, ki uničujejo DNK, zavrženi kot manj kot pasivni material za pakiranje. Z

Po žicah

Po žicah

Napaka tega članka je bila objavljena 1. januarja 2008 Znanstveniki so morda končno razvili tehnike za rekonstrukcijo celotnih ožičnih diagramov za nevronsko vezje človeških možganov. Poroča Nathan Blow. V 1880-ih letih je Santiago Ramón y Cajal začel proučevati strukturo človeških možganov na celični ravni. Več kot 100 l

Znanstvenik in pametni telefon

Znanstvenik in pametni telefon

Predmeti Matematika in računalništvo Mobilne računalniške platforme, kot je iPhone, začenjajo vdirati v laboratorij - resna perspektiva ali pravljica? Za ogled in objavo komentarjev na ta članek obiščite metogoro . Nekoč so telefone uporabljali izključno za pogovor z drugimi, računalniki pa so vodili programske aplikacije. Računalni

De novo montaža genoma: kaj bi moral vedeti vsak biolog

De novo montaža genoma: kaj bi moral vedeti vsak biolog

Predmeti Bioinformatika Algoritmi za sestavljanje gena Ker se več genomov sestavi iz nič, se znanstveniki trudijo, da bi ocenili in izboljšali njihovo kakovost. Glavno Na vprašanje, kako zrelo je področje sestavljanja genomov, ga Ian Korf na kalifornijski univerzi v Davisu primerja z najstnikom z velikimi zmožnostmi. &quo

Popravek: Primerjalna analiza metod zaporedja RNA za degradirane vzorce z majhnim vnosom

Popravek: Primerjalna analiza metod zaporedja RNA za degradirane vzorce z majhnim vnosom

Predmeti Sekvenca RNA Transcriptomics Prvotni članek je bil objavljen 19. maja 2013 Nat. Metode 10 , 623–629 (2013); objavljeno na spletu 19. maja 2013; popravljeno po 2. decembru 2013 V različici tega članka, ki je bil prvotno objavljen, je v oddelku Spletne metode „Knjižnice RNase H“ stavek, ki se začne z „Dodali smo 5 μl predhodno segreto RNase H .... ki vsebuj

Orodja za nevroznanost: vpogled v možgane

Orodja za nevroznanost: vpogled v možgane

Raziskovalci dveh nevroznanostnih centrov, ki temeljijo na Bostonu, si prizadevajo razviti nova orodja za slikanje in tehnologijo z upanjem, da bodo odkrili skrivnosti delovanja možganov. Med tednom nevroznanstvenik univerze Harvard Randy Buckner večkrat potuje med dvema pisarnama v Bostonu, eno v Martinovem centru za biomedicinsko slikanje v Charlestownu in drugo čez reko v Cambridgeu na glavnem kampusu univerze Harvard. V

Retrakcija: Nepričakovane mutacije po urejanju CRISPR – Cas9 in vivo

Retrakcija: Nepričakovane mutacije po urejanju CRISPR – Cas9 in vivo

Prvotni članek je bil objavljen 30. maja 2017 Nat. Metode 14 , 547–548 (2017); objavljeno na spletu 30. maja 2017; posodobljeno na spletu 14. junija 2017; popravljeno na spletu 25. julija 2017; umaknjeno 30. marca 2018 Ta članek se umakne, ker genomske različice, ki so jo avtorji opazili pri dveh miših, obdelanih s CRISPR, ni mogoče dokončno pripisati CRISPR-Cas9. Članek

Neparametrični preskusi

Neparametrični preskusi

Predmeti Podatki raziskav Statistične metode Popravek tega članka je bil objavljen 27. junija 2014 Ta članek je bil posodobljen Neparametrični testi zanesljivo primerjajo skenirane ali razvrščene podatke. Videli smo, da je t -test močan glede na predpostavke o normalnosti in enakovrednosti 1, zato je široko uporaben. Obstaj

Klicanje naslednje generacije afinitetnih reagentov

Klicanje naslednje generacije afinitetnih reagentov

Predmeti Generacija protiteles Kemična orodja Življenje v laboratoriju Tehnologija Kot dopolnilo protitelesom novi reagenti za ciljne beljakovine vabijo široke vrste eksperimentov. Glavno Če bi bili le reagenti, kot so protitelesa, enostavno narediti, stabilna več let, vsestranska, obnovljiva in poceni in bi lahko znanstvenikom omogočili, da naenkrat poizvedujejo beljakovine. To s

Primerjava vzorcev - del I

Primerjava vzorcev - del I

Predmeti Založništvo Podatki raziskav Statistične metode Močna primerjava parov neodvisnih ali sorodnih vzorcev zahteva različne pristope do t- testa. Med najpogostejšimi vrstami poskusov so primerjalne študije, ki kontrastne rezultate pri različnih pogojih, kot so moški v primerjavi z žensko, placebo v primerjavi z zdravilom ali pred zdravljenjem. Analiza

Grozd

Grozd

Predmeti Izkopavanje podatkov Obdelava podatkov Grozdanje najde vzorce v podatkih - ne glede na to, ali so tam ali ne. Mnoge biološke analize vključujejo razdelitev vzorcev ali spremenljivk v skupine na podlagi podobnosti ali njene obratne razdalje. V študiji genske ekspresije lahko na primer poiščemo podskupino bolnikov s podobno ekspresijo ali uporabimo komplementarni pristop in identificiramo podobno izražene gene pri pacientih. Groz

SENSOLUX® samostojna različica: neinvazivno določanje pH in DO v stresalnih bučkah

SENSOLUX® samostojna različica: neinvazivno določanje pH in DO v stresalnih bučkah

Izvleček Določitev kinetičnih parametrov rasti med zgodnjim razvojem procesa je odločilnega pomena. Več ko je pridobljenih informacij, več strategij za optimizacijo je mogoče uporabiti za ustvarjanje visoko produktivnih celičnih linij. Nova tehnologija SENSOLUX ® omogoča optično in neinvazivno merjenje pH in nasičenosti z raztopljenim kisikom v stresalnih bučkah. Ta tehnolog

Dober sodnik

Dober sodnik

Predmeti Biološke tehnike Založništvo Sodniki nudijo neprecenljivo storitev pri napredku znanosti. Ponujamo vam nekaj hrane za razmislek o tem, kako učinkovito vložiti dokumente o metodah strokovnega pregleda. Kot sodnik veste, da presojanje dela nekoga drugega ni enostavno in zahteva veliko časa in skrbi. Kot

Kvantitativna slikovna citometrija: instrumentacija izbire za avtomatizirano celično in tkivno analizo

Kvantitativna slikovna citometrija: instrumentacija izbire za avtomatizirano celično in tkivno analizo

Predmeti Celično slikanje Pretočna citometrija Izvleček Lasersko skeniranje citometrije (LSC) je izbira tehnologija za avtomatizirano, kvantitativno visoko vsebno, visokoprepustno analizo heterogenih celičnih vzorcev in vzorcev tkiv. LSC dopolnjuje protočno citometrijo, ki omogoča analizo vzorcev, pritrjenih na trdne podlage, kot so adherentne celice in vzorci tkiv. Razš