Sklep na podlagi razmerja med neravnovesjem povezave in porazdelitvijo alelnih frekvenc 240 kandidatov snps v 109 genih, povezanih z drogami, v štirih azijskih populacijah | časopis za človeško genetiko

Sklep na podlagi razmerja med neravnovesjem povezave in porazdelitvijo alelnih frekvenc 240 kandidatov snps v 109 genih, povezanih z drogami, v štirih azijskih populacijah | časopis za človeško genetiko

Anonim

Izvleček

Obsežna nukleotidna raznolikost v genih, povezanih z zdravili, posameznike nagiba k različnim odzivom na zdravila in je velik problem v trenutni klinični praksi in razvoju zdravil. V teh genih med populacijami obstajajo presenetljive alelne razlike v pogostosti. V tej raziskavi smo genotipizirali 240 mest, za katera je znano, da so pri japonski populaciji polimorfni pri vsakem od 270 nepovezanih zdravih posameznikov, ki vključujejo po 90 malezijskih Malajcev, Indijcev in Kitajcev. Ta mesta so razporejena v 109 genov, ki so povezani z zdravili, kot so geni, ki kodirajo encime, ki presnavljajo drogo, in prenašalce zdravil. Določili smo in primerjali frekvenco alelov in neenakomerno porazdelitev teh krajev. Primerjali so jih tudi s podobnimi podatki 752 Japoncev. Med japonskimi, malezijskimi kitajskimi in malezijskimi prebivalci so opazili obsežne podobnosti v frekvencah alelov in porazdelitev neravnovesja povezav. Vendar so bile opažene pomembne razlike med japonskimi in malezijskimi Kitajci z malezijskimi Indijanci. Te štiri populacije so bile razvrščene v dva genska grozda različnih prednikov. Vendar pa je bila ugotovljena večja povezava med malezijskimi Malezijci in Indijci, kar kaže na obstoj močne mešanice med njimi. Rezultati pomenijo tudi možno in racionalno uporabo obstoječih baz podatkov o polimorfizmu z enim nukleotidom kot referencami za pomoč pri prihodnjih farmakogenetskih študijah, ki vključujejo populacije s podobnimi predniki.