Dednost (April 2020)

Pretekle klimatske spremembe pojasnjujejo filogeografijo Vitellaria paradoxa nad Afriko

Pretekle klimatske spremembe pojasnjujejo filogeografijo Vitellaria paradoxa nad Afriko

Predmeti Biogeografija Sprememba podnebja Filogenija Rastlinska genetika Prvotni članek je bil objavljen 16. marca 2011 Popravek : dednost (2011) 107 , 174–186; doi: 10.1038 / hdy.2011.5 Po objavi tega leta v zvezku 107 so avtorji v rubriki Razprave opazili tipkarsko napako glede dobe študija. V pododstavku odstavka „Filogeografski vzorec, ki ga povzročajo podnebne spremembe“, bi moral biti na strani 184 stavek: Palinološke študije so poročale o migracijah ljudi in agropastoralnih dejavnostih, ki so vključevale drevesa shea pred 1000 leti v Burkini (Neumann in sod. , 1998), v

Raznovrstnost vrst mladoletnikov v divjih populacijah guppyjev

Raznovrstnost vrst mladoletnikov v divjih populacijah guppyjev

Predmeti Vedenjska ekologija Genska variacija Model nevretenčarjev Izvleček Združevanje posameznikov ponuja številne potencialne koristi v zvezi s hranjenjem in zaščito pred plenilci. Vendar pa se predlaga, da bi posamezniki lahko pridobili dodatne koristi v smislu posredne kondicije s skupino v sorodstvu. Pres

Grozdi U1 snDNA v kobilicah: kromosomska dinamika in genomska organizacija

Grozdi U1 snDNA v kobilicah: kromosomska dinamika in genomska organizacija

Predmeti Citogenetika Izvleček Spliceosom, sestavljen iz beljakovinskega nabora, povezanega z majhno jedrsko RNA (snRNA), je odgovoren za zorenje mRNA z odstranjevanjem introna. Med geni snRNA je U1 na splošno ohranjeno ponavljajoče se zaporedje. Za razkritje kromosomske / genske dinamike te večgeneracijske družine pri kobilih smo uvrstili gene U1 s fluorescenco in situ hibridizacijo pri 70 vrstah iz družin Proscopiidae, Pyrgomorphidae, Ommexechidae, Romaleidae in Acrididae. Pri

Prostorska heterogenost v moči selekcije proti škodljivim alelom in mutacijski obremenitvi

Prostorska heterogenost v moči selekcije proti škodljivim alelom in mutacijski obremenitvi

Predmeti Evolucijska ekologija Mutacija Izvleček Po trenutnih ocenah števila genomskih škodljivih mutacij (ki so pogosto vrstnega reda 0, 1–1) je mutacijska obremenitev (opredeljena kot zmanjšanje povprečne sposobnosti prebivalstva zaradi prisotnosti škodljivih alelov) pomembna pri številnih populacijah. V tem p

Demografska zgodovina, trenutna širitev in prihodnji izzivi populacije divjih prašičev na Balkanu in v Evropi

Demografska zgodovina, trenutna širitev in prihodnji izzivi populacije divjih prašičev na Balkanu in v Evropi

Predmeti Genetski markerji Tehnike, ki temeljijo na PCR Izvleček Divji prašič ( Sus scrofa ), ena najbolj razširjenih vrst prostoživečih živali, je v Evropi stopil v nenehno rast in bi jo lahko celo obravnavali kot škodljivca. Analizirali smo mikrosatelitsko spremenljivost pri 723 divjih prašičih iz vse Evrope, vključno s severnim Dinarskim Balkanom. Naši cilj

Genetska in funkcionalna modularnost: kako organizem reši skoraj neskončen prostor genetskih / okoljskih problemov?

Genetska in funkcionalna modularnost: kako organizem reši skoraj neskončen prostor genetskih / okoljskih problemov?

Predmeti Poskusni organizmi Genska variacija Modularnost, koncept, da skupina predmetov deluje skupaj in so manj povezani s predmeti znotraj drugih skupin, je bil ključni koncept, ki temelji na številnih raziskovalnih področjih od kvantitativne genetike do računske biologije. V genetskem smislu je variacijski modul sestavljen iz lastnosti, ki se med seboj razlikujejo in so neodvisne od drugih modulov (Wagner in Altenberg, 1996). V

Različnost in omejitev v razvoju in razvoju rastlin

Različnost in omejitev v razvoju in razvoju rastlin

Izvleček Cilj tega kratkega pregleda je preučiti medsebojno povezane pojave fenotipske variacije in genske omejitve glede na raznolikost rastlin. Edinstveni vidiki rastlin, vključno s sedečimi navadami, modularno rastjo in raznovrstnimi razvojnimi programi, izraženimi na fitomerski ravni, zaslužijo natančno preučevanje genetske osnove njihove fenotipske variacije ter način njihovega doživljanja in preprečevanja genetske omejitve. Številne

Teoretični okvir populacijske genetike z upoštevanimi somatskimi mutacijami: uporaba za kopiranje variacij števila pri ljudeh

Teoretični okvir populacijske genetike z upoštevanimi somatskimi mutacijami: uporaba za kopiranje variacij števila pri ljudeh

Predmeti Mutacija Populacijska genetika Strukturne variacije Izvleček Tradicionalno se populacijska genetika osredotoča na dinamiko frekvenc alelov, pridobljenih z mutacijami na zarodnih linijah, saj so le take mutacije dedne. Tipični poskusi genotipizacije pa uporabljajo DNK iz nekaterih somatskih tkiv, kot je kri, ki poleg somatskih mutacij, nakopičenih od zadnjega skupnega prednika vzorca, nabere somatske mutacije trenutne generacije. Ta

Več genskih podpisov selekcije pri kozah in ovcah, vročih v suhem okolju

Več genskih podpisov selekcije pri kozah in ovcah, vročih v suhem okolju

Predmeti Evolucijska biologija Genetika Izvleček Koze in ovce so vsestranski domobranci, ki so bili integrirani v različna okolja in proizvodne sisteme. Naravna in umetna selekcija sta oblikovala variacijo obeh vrst, vendar je naravna selekcija igrala glavno vlogo med avtohtonimi jatami. Za preučevanje signalov naravne selekcije smo analizirali podatke o genotipih, pridobljenih z uporabo koze in ovc 50K SNP BeadChips iz barkijskih koz in ovc, ki so domorodni v vročem sušnem okolju v egiptovski obalni coni Zahodne puščave. Ident

Vremensko nihanje v razprševanju in gnezditveni strukturi cvetnega prahu v nevtropičnem drevesu, oprašenem s čebelami

Vremensko nihanje v razprševanju in gnezditveni strukturi cvetnega prahu v nevtropičnem drevesu, oprašenem s čebelami

Predmeti Modelne rastline Reja rastlin Opraševanje Izvleček Spremembe med sezonami cvetenja v času cvetenja, sinhronija in dolžina cvetenja ter nihanja v številčnosti opraševalcev lahko povzročijo nihanje razpršitve cvetnega prahu. V tej raziskavi smo analizirali časovno variacijo razpršitve in gnezditvene strukture peloda pri nevtropskih drevesnih vrstah Tabebuia aurea (Bignoniaceae) in ovrednotili razprševanje cvetnega prahu med populacijo znotraj rezerve in obližem osamljenih posameznikov na robu rezervata ter preizkusili hipoteza, da osamljeni posamezniki potopijo cvetni prah. Vzorčena so

Odpornost genetike razdrobljenosti gozdov - ni več paradoks - smo samo iskali napačno mesto

Odpornost genetike razdrobljenosti gozdov - ni več paradoks - smo samo iskali napačno mesto

Predmeti Gozdarstvo Populacijska genetika Izvirni članek je bil objavljen 15. julija 2015 Popravek: dednost (2015) 115, 97–99; doi: 10.1038 / hdy.2015.40 Avtorji želijo spremeniti datum naslednjega sklicevanja od leta 2010 do 2011. Pravilna referenca bi se morala pojaviti na naslednji način: Bacles CFE, Jump AS (2011). Z v

Študija asociacije na več genskih lastnosti z več značilnostmi, ki temelji na analizi glavnih komponent za matriko preostale kovariance

Študija asociacije na več genskih lastnosti z več značilnostmi, ki temelji na analizi glavnih komponent za matriko preostale kovariance

Predmeti Študije povezav z genomi Popravek tega članka je bil objavljen 11. marca 2015 Izvleček Glede na pomanjkljivosti izvajanja multivariatne analize za preslikavo več lastnosti v genomski povezavi (GWAS) je bila analiza glavnih komponent (PCA) široko uporabljena za ustvarjanje neodvisnih „super lastnosti“ iz prvotnih multivariatnih fenotipskih lastnosti za univariatno analizo. Vendar

Pretok genov in populacijska struktura navadne kmetijske divje vrste (Microtus agrestis) v različnih režimih upravljanja zemljišč

Pretok genov in populacijska struktura navadne kmetijske divje vrste (Microtus agrestis) v različnih režimih upravljanja zemljišč

Predmeti Kmetijstvo Konzervacijska biologija Populacijska genetika Izvleček Vpliv krajinske strukture in upravljanja zemljišč na širjenje populacij divjih vrst, ki naseljujejo kmetijsko krajino, je bil raziskan s poudarkom na poljski voluharici ( Microtus agrestis ) na treh različnih območjih na Danskem z uporabo molekularno genetskih markerjev. Glav

Bryan Clarke

Bryan Clarke

Predmeti Znanstvena skupnost Bryan Clarke, ki je umrl v starosti 81 let, je bil pionir ekološke genetike. Študiral je pri EB Fordu in AJ Cainu na Oxfordu in bil del generacije, ki je prebivalstvo in evolucijsko biologijo reševala iz svojega dolgotrajnega spogledovanja s Scyllo zamrznjene matematične natančnosti, ki jo ni mogoče nadgraditi z dejstvi in ​​Charybdisom zbiranja podatkov brez idej. Če pogle

Genska arhitektura odpornosti Daphnia gostuje proti dvema vrstama parazitov, značilnih za gostitelja

Genska arhitektura odpornosti Daphnia gostuje proti dvema vrstama parazitov, značilnih za gostitelja

Predmeti Evolucija parazita Pazitska genetika Izvleček Razumevanje genske arhitekture odpornosti gostitelja je ključnega pomena za razumevanje razvoja interakcij gostitelj-parazit. Evolucijski modeli pogosto domnevajo preprosto genetiko, ki temelji na nekaj lokusih in močni epistazi. Ni pa znano, ali te predpostavke veljajo za naravne populacije. S

Cvetna evolucija: enostranska evolucija ali dve? Odgovor Ennosu

Cvetna evolucija: enostranska evolucija ali dve? Odgovor Ennosu

Čeprav je bil izraz „koevolucija“ skovan pred manj kot 50 leti (Ehrlich in Raven, 1964), je več kot 100 let pred tem Darwin prvič opisal postopek za izračun usklajenosti dolžine jezika in cevi čebeljih vrst in vrst detelje obiskali (Darwin, 1859). O tem postopku je razložil, ko je opisal izjemno dolg vzpon Angraecum sesquipedale in napovedal molj opraševalca z enako dolgim ​​jezikom (Darwin, 1862). Darwin je načr

Kvantitativna genska variacija v nadzoru apoptoze jajčnikov v različnih okoljih

Kvantitativna genska variacija v nadzoru apoptoze jajčnikov v različnih okoljih

Izvleček Izguba plodnosti pri sicer zdravih posameznikih je lahko evolucijska zagonetka. Večina raziskav o razvoju post-reproduktivne življenjske dobe se osredotoča na fitnes učinke preživetja pred starostjo zadnjega razmnoževanja. Komplementarni pristop, ki je bil v veliki meri zapostavljen, je razviti razumevanje narave variacije mehanizma, na katerem temelji izguba plodnosti, apoptoza jajčnikov. Razlik

Antagonistična pleiotropija lahko pomaga pri izbiri na populaciji pri ohranjanju genetskega polimorfizma za hitrost prenosa v vzorčni fitopatogeni glivi

Antagonistična pleiotropija lahko pomaga pri izbiri na populaciji pri ohranjanju genetskega polimorfizma za hitrost prenosa v vzorčni fitopatogeni glivi

Izvleček Teoretično je dokazano, da so pogoji za vzdrževanje polimorfizma v pleiotropnih lokusih z antagonističnimi učinki na fitnes komponente precej restriktivni. Tukaj uporabljamo metapopulacijski model, da raziskujemo, ali bi antagonistični pleiotropija lahko pomagala pri vzdrževanju polimorfizma, ki vključuje skupne škodljive alele v fitopatogeni glivi Microbotryum violaceum . Ta gliv

Obsežna mitohondrijska introgresija v severnoameriških velikih črnokrvnih galebih (Larus marinus) iz ameriškega sleda galeba (Larus smithsonianus) z majhnim vplivom jedrske DNK

Obsežna mitohondrijska introgresija v severnoameriških velikih črnokrvnih galebih (Larus marinus) iz ameriškega sleda galeba (Larus smithsonianus) z majhnim vplivom jedrske DNK

Predmeti Evolucijska biologija Populacijska genetika Izvleček Nedavne genetske študije so pokazale, da se lahko hitrost samostojnosti med lokusi močno razlikuje glede na njihovo lokacijo v genomu. Zlasti so poročali o več primerih mito-jedrskih neskladnosti za širok spekter organizmov. V pričujoči študiji preučujemo vzroke za neskladje med mitohondrijskim (mtDNA) in jedrsko introgresijo DNK, odkritim v severnoameriških populacijah velikega črnolasoga galeba ( Larus marinus ), holarktične vrste, iz skorajdaškega severnoameriškega sledovega galeba ( Larus smithsonianus ). Naši rezultat

O vlogi, ki jo igrajo nosilnost in velikost prednikov med širjenjem obsega

O vlogi, ki jo igrajo nosilnost in velikost prednikov med širjenjem obsega

Predmeti Evolucijska teorija Izvleček Večina vrst je strukturiranih, za raziskovanje njihove zgodovine pa so bili predlagani različni modeli populacijske genetike. Zaradi matematične sledljivosti večina teh modelov poenostavi domnevo ravnotežja. Tu se osredotočamo na lastnosti neenakomernega prostorskega eksplicitnega modela, razširitve razponov (REs). Kljub

Spreminjanje prednosti mate v hibridnem območju hišne miške

Spreminjanje prednosti mate v hibridnem območju hišne miške

Izvleček Znano je, da se premiki razmnoževalnega znaka pojavljajo na mejah sekundarnega kontaktnega območja med obema evropskim podvrstima hišne miške (v Jutlandu na Danskem), kjer pride do selekcije proti hibridizaciji. Ta študija je ocenila vzorce preferenc mate pri naravnih hibridih obeh podvrst. Izbi

Kaj pojasnjuje redke in vidne barve polža? Test podatkov časovnih vrst glede na modele pomika, selitve ali izbire

Kaj pojasnjuje redke in vidne barve polža? Test podatkov časovnih vrst glede na modele pomika, selitve ali izbire

Predmeti Genska variacija Izvleček Navdušujoče je, da se vidni barvni morfiji plenilske vrste lahko vzdržujejo ob nizkih frekvencah skupaj s kriptičnimi morfi. Pogosto se predlaga negativna izbira, ki je odvisna od pogostosti plenilcev, ki uporabljajo iskalne slike ("odpadna izbira"), ne da bi zavrnili alternativna pojasnila. S p

Visoka Y-kromosomska raznolikost in nizka sorodnost med očetovskimi rodovi v skupnem merilu v zahodnoevropskih nizkih državah med določitvijo priimka

Visoka Y-kromosomska raznolikost in nizka sorodnost med očetovskimi rodovi v skupnem merilu v zahodnoevropskih nizkih državah med določitvijo priimka

Predmeti Strukturne variacije Izvleček O biološki povezanosti med državljani in demografski dinamiki v vaseh, mestih v zahodni Evropi pred 17. stoletjem je malo znanja. S kombiniranjem genotipov Y-kromosomov, poglobljenih rodoslovnih in priimkovnih podatkov v strogem genetsko-genealoškem pristopu je mogoče zagotoviti vpogled v gensko raznolikost in povezanost avtohtonih očetovskih rodov v določeni skupnosti ob sprejetju priimka. Za pr

Zaloga žuželke-endosimbiont

Zaloga žuželke-endosimbiont

Raziskave v zadnjih 20 letih so pokazale, da ima velik del žuželk intimne povezave s simbiotskimi bakterijami, ki imajo pogosto velike vplive na njihovo biologijo. Nekateri simbionti so vzajemni, ki povečujejo telesno sposobnost svojega gostitelja, medtem ko v drugih primerih gostitelj ne prenese mikroorganizma ali nima nobene koristi. B

Heritabilnost hitrosti razpršitve in druge lastnosti življenjske zgodovine pri fritillary metulju Glanville

Heritabilnost hitrosti razpršitve in druge lastnosti življenjske zgodovine pri fritillary metulju Glanville

Izvleček Poznavanje razlik in dednosti ( h 2 ) lastnosti življenjske zgodovine pri prebivalstvu, ki živi v naravnih pogojih, je potrebno za mehanično razumevanje posameznih evolucijskih procesov. Drevesnost več značilnosti življenjske zgodovine, vključno s stopnjo razpršenosti, telesno maso, starostjo ob prvi reprodukciji, jajčno maso, velikostjo sklopke in življenjskim uspehom pri reprodukciji, sem uporabil regresijo matičnega potomca Glanville. Poskusi so

Spremembe območja Potentilla fruticosa na Qinghai-tibetanski planoti v ledeniških in medgladečnih obdobjih, razkritih z variacijo DNK kloroplasta

Spremembe območja Potentilla fruticosa na Qinghai-tibetanski planoti v ledeniških in medgladečnih obdobjih, razkritih z variacijo DNK kloroplasta

Izvleček Qinghai-tibetanska planota je eden najobsežnejših habitatov alpskih rastlin na svetu. Zato lahko vzorci genske variacije populacij na planoti razkrijejo podrobno demografsko zgodovino alpskih rastlin. Analizirali smo geografsko strukturo variacije zaporedja mat kloroplastov mat K v Potentilla fruticosa L. (

Molekularni in celični mehanizmi raznolikosti v sortah vinske trte

Molekularni in celični mehanizmi raznolikosti v sortah vinske trte

Izvleček Sorta vinske trte je sestavljena iz niza klonov, ki so bili vegetativno razmnoženi z ene izbrane trte, gojene iz ene same sadike. Večina klonov znotraj sorte je identičnih, nekateri pa lahko kažejo divergentne genotipe in do neke mere divergentne fenotipe. Polimorfizem izhaja predvsem iz somatskih mutacij, ki se naravno pojavljajo med rastjo rastlin. Za

Gensko preslikavanje sterilnih genov z epistazo v hrbtnih modelih

Gensko preslikavanje sterilnih genov z epistazo v hrbtnih modelih

Predmeti Genska interakcija Gensko kartiranje Hibridizacija rastlin Izvleček Kartiranje sterilnih genov je bistveno vprašanje, ki ga je treba rešiti za raziskovanje mehanizma sterilnosti pri široki hibridizaciji rastlin. Vendar prej razvite metode ne morejo rešiti problema preslikave sterilnih lokusov z epistazo. V t

Karakterizacija cvetočih mutantov, ki jih ustvarijo rentgenski žarki, ki nosijo delecije na S-lokusu razgledne Turnera subulata

Karakterizacija cvetočih mutantov, ki jih ustvarijo rentgenski žarki, ki nosijo delecije na S-lokusu razgledne Turnera subulata

Predmeti Modelne rastline Mutacija Rastlinska genetika Prvotni članek je bil objavljen 14. aprila 2010 Popravek: dednost (2010) 105, 235–243; doi: 10.1038 / hdy.2010.39; objavljeno na spletu 14. aprila 2010 Avtorji so odkrili napako, ki bi jo radi popravili. Slika 3, Karakterizacija 12 mutantov S- lokusa, prikazuje dva markerja ( RP81E18 in P9SP1 ) na razdaljah <0, 5 oziroma 0, 5 cM. D

Zaznavanje epistatičnih interakcij v združenjih za kartiranje populacij: primer tetraploidnega krompirja

Zaznavanje epistatičnih interakcij v združenjih za kartiranje populacij: primer tetraploidnega krompirja

Predmeti Računalniški modeli Gensko kartiranje Rastlinska genetika Izvleček Pričakuje se, da bodo epistatične interakcije med lokusi znatno prispevale k spreminjanju količinskih lastnosti. Cilji naše raziskave so bili: (i) primerjati klasični pristop mešanega modela s kombiniranim mešanim modelom in analizo variacijskega pristopa za odkrivanje epistatičnih interakcij; (ii) s pomočjo računalniških simulacij preuči statistično moč za zaznavanje epistatičnih interakcij aditiv, aditiv, aditiv, prevlade in prevlade in prevlade in (iii) odkrije epistatične interakcije med kandidatnimi geni za odporno

Število somatskih škodljivih mutacij v gozdnati rastlini: ocena iz fenotipskih podatkov

Število somatskih škodljivih mutacij v gozdnati rastlini: ocena iz fenotipskih podatkov

Predmeti Inbreeding Mutacija Rastlinska genetika Izvleček Izvedli smo nadzorovane križanje v populacijah dolgo živečega kloničnega grmička, Vaccinium angustifolium (borovnica z nizko grmovjem), da smo ocenili inbreeding depresijo in mutacijske parametre, povezane s somatsko škodljivo mutacijo. Stopn

Kontrastni odzivi na izbiro pri glavnih označevalcih, povezanih s histokompatibilnostjo, pri lososu razreda I in razreda II

Kontrastni odzivi na izbiro pri glavnih označevalcih, povezanih s histokompatibilnostjo, pri lososu razreda I in razreda II

Predmeti Evolucijska ekologija Genetski markerji Ihtiologija Populacijska genetika Izvleček Primerjava ravni in vzorcev genske variacije naravnih populacij bodisi v lokusih bodisi v nasprotju z nevtralnim pričakovanjem lahko da vpogled v razlike v moči in smeri evolucijskih sil, značilnih za lokus. Ob

Nizka genska raznolikost in močna struktura populacije, ki jo oblikuje antropogena fragmentacija habitata v kritično ogroženem primatu Trachypithecus leucocephalus

Nizka genska raznolikost in močna struktura populacije, ki jo oblikuje antropogena fragmentacija habitata v kritično ogroženem primatu Trachypithecus leucocephalus

Predmeti Konzervacijska biologija Populacijska genetika Izvleček Razdrobljenost habitatov lahko močno vpliva na genetsko strukturo prebivalstva in zmanjša gensko raznolikost in sposobnost preživetja majhnih in izoliranih populacij. Beloglavi langur ( Trachypithecus leucocephalus ) je kritično ogrožena vrsta primatov, ki živi na zelo razdrobljenem in človeško spremenjenem habitatu na jugu Kitajske. Preučil

Analiza strukture, raznolikosti in fino preslikavo mendelskih lastnosti pri tradicionalnih in vaških piščancih

Analiza strukture, raznolikosti in fino preslikavo mendelskih lastnosti pri tradicionalnih in vaških piščancih

Predmeti Genska variacija Študije povezav z genomi Genotipizacija in haplotipizacija Populacijska genetika Izvleček Obsežne fenotipske variacije so običajna značilnost med vaškimi piščanci, ki jih najdemo po večjem delu sveta v razvoju, in pri tradicionalnih pasmah piščancev, ki so jih umetno izbrali za lastnosti, kot je sorta čemaža. Tu predstav

RNAi in epigenetika: Pol IV je izdelovalec majhnih RNK, ki se srečujejo s kromatinom

RNAi in epigenetika: Pol IV je izdelovalec majhnih RNK, ki se srečujejo s kromatinom

Pri različnih vrstah evkariotov lahko dvoverižna RNA (dsRNA) povzroči široko paleto pojavov utišanja genov na način, ki je odvisen od zaporedja, bodisi na ravni transkripcije bodisi na stopnji transkripcije (Matzke in Birchler, 2005). Glavna biološka vloga takšnega utišanja je ponavadi zaščita pred invazivnimi nukleinskimi kislinami, vključno z virusi in retrotranspozoni, ter ohranjanje kromosomske stabilnosti. V rastlins

Skrivnost jegulje: čas naredi pomen

Skrivnost jegulje: čas naredi pomen

Populacijske genetske študije, ki poročajo navidezno negativne rezultate, kot je pomanjkanje pomembnih razlik, le redko končajo v naslovih vodilnih znanstvenih revij. Delo Palm in sod. (2009) pa to stori natančno z uporabo obsežnega časovnega nabora podatkov, ki kaže, da je kljub temu, da je evropska jegulja ( Anguilla anguilla ) kljub več nedavnim trditvam še vedno lahko obravnavana kot enotna, prostorsko homogena populacija. Življen

Ocenjevanje anizotropne razpršitve cvetnega prahu: študija primera v Quercus lobata

Ocenjevanje anizotropne razpršitve cvetnega prahu: študija primera v Quercus lobata

Izvleček Porazdelitev cvetnega prahu je pomemben element velikosti sosednjih rastlin. Večina metod, namenjenih oceni razpršene krivulje, predvideva, da je razprševanje cvetnega prahu izotropno, vendar dokazi kažejo, da ta predpostavka ne velja za številne rastlinske vrste, zlasti vrste, ki jih oprašujejo vetrovi, ki prevladujejo vetrovi v sezoni opraševanja. Tu pre

Kaj povzroča spremembe parjenja v rastlinah? Arabidopsis lyrata kot študija primera

Kaj povzroča spremembe parjenja v rastlinah? Arabidopsis lyrata kot študija primera

Predmeti Samopoštevnost Popravek tega članka je bil objavljen 7. decembra 2016 Izvleček Genska razčlenitev samo-nezdružljivosti (SI) in kasnejši sistem parjenja preidejo na inbreeding že desetletja spletkajo evolucijske genetike. Večina našega znanja izhaja iz medoznačnih primerjav med križanimi vrstami in njihovimi zunajrodnimi sorodniki, kjer lahko sklepanje zmede sekundarne mutacije, ki so nastale po prvotni izgubi SI. Tu preuču

Čiščenje škodljivih mutacij v konzervacijskih programih: kombiniranje optimalnih prispevkov z inbrednimi maturami

Čiščenje škodljivih mutacij v konzervacijskih programih: kombiniranje optimalnih prispevkov z inbrednimi maturami

Predmeti Biotska raznovrstnost Konzervacijska biologija Inbreeding Populacijska genetika Izvleček Cilj programov ohranjanja je zmanjšati izgubo genske raznolikosti, kar omogoča populaciji, da se prilagodi potencialnim spremembam v okolju. To je mogoče doseči z izračunom, koliko potomcev bi moral vsak posameznik prispevati k naslednji generaciji, da bi čim bolj zmanjšali globalno koancerstvo. Vendar

Vremenske spremembe v frekvencah alelov, vendar stabilna genetska raznolikost v zadnjih 40 letih v populaciji irskega morja trnovskega žarka, Raja clavata

Vremenske spremembe v frekvencah alelov, vendar stabilna genetska raznolikost v zadnjih 40 letih v populaciji irskega morja trnovskega žarka, Raja clavata

Izvleček Žare in drsalke so neizogiben del prilova pri pridnenem ribolovu. V zadnjih 40 letih se je trnovski žarek ( Raja clavata ) zmanjšal in na nekaterih območjih celo izginil, kar je povzročilo zaskrbljenost zaradi genetskega tveganja. Zaradi tega so za populacijo trnovitih žarkov v Irskem morju in Bristolskem kanalu ocenili učinkovito velikost populacije ( N e ), stopnjo migracije ( m ) in časovne spremembe v genski raznolikosti. Z genot

Udomačenje piščancev: posodobljena perspektiva, ki temelji na mitohondrijskih genomih

Udomačenje piščancev: posodobljena perspektiva, ki temelji na mitohondrijskih genomih

Predmeti Genska variacija Mitohondrijski genom Filogenija Izvleček Domače piščance ( Gallus gallus domesticus ) izpolnjujejo različne vloge, od hrane in zabave do religije in okraskov. Da bi raziskali njegovo gensko raznolikost in izsledili zgodovino udomačevanja, smo raziskali skupno 4938 fragmentov mitohondrijske DNK (mtDNA), vključno z 2843 prej objavljenimi in 2095 novimi enotami od 2044 domačih piščancev in 51 rdečih džungle ( Gallus gallus ). Za pridobi

Populacijska struktura dlak (Platichthys flesus) v Baltskem morju: razlike med pridnenimi in pelagičnimi drstišči

Populacijska struktura dlak (Platichthys flesus) v Baltskem morju: razlike med pridnenimi in pelagičnimi drstišči

Izvleček Z mikrosatelitskimi genetskimi markerji smo ugotovili pomembno strukturo populacije in izoliranost med vzorci moke ( Platichthys flesus ) v Baltskem, Kattegatu in Skagerraku. Ta vzorec je bil skoraj v celoti posledica razlike med iverkami, ki imajo drseče drstišča na severnem Baltiku, v primerjavi s pelagičnimi drstišči na južnem Baltiku in na zahodni obali Švedske. Med goz

Ocena stopnje prekrivanja na hierarhični ravni sadja, posameznikov, populacije in vrst v Magnolia stellata

Ocena stopnje prekrivanja na hierarhični ravni sadja, posameznikov, populacije in vrst v Magnolia stellata

Izvleček Pri rastlinskih vrstah z mešanimi sistemi parjenja razlike v različnih dejavnikih - vključno z njihovim sistemom opraševanja, cvetočo fenologijo, življenjsko obliko in dovzetnostjo za debelost pri križanju - povzročajo razlike v stopnjah prekrivanja plodov med posamezniki, med posamezniki znotraj populacije in med populacijami znotraj vrst. Za koli

Genetska reinkarnacija delavcev kot matic v vzhodni čebeli Apis cerana

Genetska reinkarnacija delavcev kot matic v vzhodni čebeli Apis cerana

Predmeti Družbena evolucija Izvleček Tektitna partenogeneza ali aseksualna proizvodnja samcev potomcev je v živalskem kraljestvu redka, vendar je pri družbi Hymenoptera razmeroma pogosta. Vendar pa je pri čebeljih pčelah znano, da je vseprisotna le v eni podvrsti vrste Apis mellifera , rta rta, A. mell

Specifikacija, ki upočasnjuje razširjene in dolgo živeče drevesne taksone: vpogled v rod tropskega lesa Milicia (Moraceae)

Specifikacija, ki upočasnjuje razširjene in dolgo živeče drevesne taksone: vpogled v rod tropskega lesa Milicia (Moraceae)

Predmeti Filogenetika Rastlinska genetika Specifikacija Izvleček Dolg čas generacije in velika učinkovita velikost razširjenih vrst gozdnih dreves lahko povzroči počasno evolucijsko hitrost in nepopolno razvrščanje rodovnikov, kar zaplete razmejitev vrst. To vprašanje smo obravnavali z afriškim rodom Milicia, ki obsega dve morfološko podobni in pogosto zmedeni vrsti: M. excelsa ,

Rekonstrukcija izbruhov bolezni iz genetskih podatkov: grafični pristop

Rekonstrukcija izbruhov bolezni iz genetskih podatkov: grafični pristop

Predmeti Epidemiologija nalezljivih bolezni Filogenetika Izvleček Epidemiologija in javnozdravstveno načrtovanje se bosta vedno bolj opirala na analizo podatkov o genskem zaporedju. Zlasti se lahko genetski podatki skupaj z datumi in lokacijami vzorčenih izolatov uporabijo za rekonstrukcijo prostorsko-časovne dinamike patogenov med izbruhi. Za

Večgeneracijska hibridizacija in njene posledice za materine učinke v atlantskem lososu

Večgeneracijska hibridizacija in njene posledice za materine učinke v atlantskem lososu

Predmeti Reja živali Genska hibridizacija Izvleček Prekoračitev med ločeno populacijo je lahko pomembna z evolucijskega, ohranitvenega in ekonomsko-kmetijskega vidika. Ali in kako prehranjevanje vpliva na materine učinke pri divjih populacijah, so redko preučevali, kljub izrazitemu materinemu vplivu na zgodnje preživetje potomcev in znani prisotnosti kondicijskih učinkov, ki izhajajo iz prehitevanja številnih taksonov. V fazi

Plio-pleistocenska zgodovina in filogeografija akanijevega senegala v suhih gozdovih in savanah podsaharske tropske Afrike: dokazi o zgodnji kolonizaciji in nedavni razširitvi območja

Plio-pleistocenska zgodovina in filogeografija akanijevega senegala v suhih gozdovih in savanah podsaharske tropske Afrike: dokazi o zgodnji kolonizaciji in nedavni razširitvi območja

Predmeti Genska variacija Filogenetika Rastlinska genetika Izvleček Suhišča so obsežna po podsaharski Afriki, so družbenoekonomsko in ekološko pomembna, vendar zelo občutljiva na okoljske spremembe. Evolucijska zgodovina, kot jo razkriva sodobna znotrajspecifična genetska variacija, lahko daje dragocen vpogled v to, kako so se vrste odzvale na pretekle spremembe v okolju in populaciji, ter usmerja strategije za spodbujanje odpornosti na prihodnje spremembe. Dreves

Povezava transkriptomske in genomske variacije z rastjo hibridov potoka Charr (Salvelinus fontinalis, Mitchill)

Povezava transkriptomske in genomske variacije z rastjo hibridov potoka Charr (Salvelinus fontinalis, Mitchill)

Predmeti Genska hibridizacija Genska variacija Populacijska genetika Transcriptomics Izvleček Hibridizacija lahko privede do fenotipskih razlik, ki izhajajo iz sprememb vzorcev genske ekspresije ali novih kombinacij alelov. Menijo, da variacijo izražanja genov nadzirajo razlike v regulaciji transkripcije starševskih alelov bodisi s pomočjo cis- ali transregulacijskih elementov. Pr

Sledi srednjeveških migracij pri socialno stratificiranem prebivalstvu iz severne Italije. Dokazi o enostranskih označevalcih in globoko zakoreninjenih rodovnikih

Sledi srednjeveških migracij pri socialno stratificiranem prebivalstvu iz severne Italije. Dokazi o enostranskih označevalcih in globoko zakoreninjenih rodovnikih

Predmeti Kulturna evolucija Genetski markerji Dinamika prebivalstva Populacijska genetika Izvleček Socialni in kulturni dejavniki so imeli odločilno vlogo pri določanju genske strukture Evrope. Zato se lahko socialno stratificirano prebivalstvo pomaga osredotočiti na posebne primere evropske demografske zgodovine. V

Dešifriranje fine strukture plemenskih primesi v beduinskem prebivalstvu s pomočjo genskih podatkov

Dešifriranje fine strukture plemenskih primesi v beduinskem prebivalstvu s pomočjo genskih podatkov

Predmeti Populacijska genetika Izvleček Izraelsko prebivalstvo beduinov je zelo poseljeno in strukturirano z zelo veliko razširjenostjo recesivnih bolezni. Mnoge študije v zadnjih dveh desetletjih so se osredotočale na analizo povezav v velikih, več sorodnih rodovnikih te populacije. Pojav visokoproizvodnih tehnologij je raziskovalce motiviral za iskanje redkih različic med manjšimi rodovniki, ki so vključevali podatke iz klinično podobnih, a na videz nepovezanih sporadičnih primerov. Vendar s

Ali je homoploidna hibridna specifikacija redka? Empirični pogled

Ali je homoploidna hibridna specifikacija redka? Empirični pogled

Predmeti Evolucija Evolucijska teorija Filogenetika Naravna hibridizacija in njena vloga v evoluciji in zlasti pri ustvarjanju nove raznolikosti je stara in še vedno neskončno oživljena tema (Lotsy, 1916; Anderson, 1949; Stebbins, 1959; Rieseberg idr., 2003; Mallet, 2007; Soltis in Soltis, 2009 ; Larsen in sod.,

Genska struktura temeljne vrste: spreminjanje fenotipov skupnosti od posameznika do regije

Genska struktura temeljne vrste: spreminjanje fenotipov skupnosti od posameznika do regije

Izvleček Razumevanje lokalnih in regionalnih vzorcev razširjanja vrst je bil glavni cilj ekoloških in evolucijskih raziskav. Pojem, da je mogoče te vzorce razumeti s preprostimi količinskimi pravili, je privlačen, vendar kljub temu, da obstajajo številni zakoni o skaliranju (npr. Presnovni, fraktalni), ne poznamo nobenih študij, ki bi posamezne lastnosti in strukturo skupnosti postavile skupaj v okvir za določanje genetskega merjenja . Možnost

Genska raznolikost in pretok genov upadata z višino v montanskih metuljih

Genska raznolikost in pretok genov upadata z višino v montanskih metuljih

Predmeti Ekološka genetika Populacijska genetika Izvleček Montanska okolja po vsem svetu so "žarišča" biotske raznovrstnosti in pomembni rezervoarji genske raznolikosti. Montanske vrste so prav tako običajno bolj izpostavljene spremembam v okolju kot njihovi kolegi z nizko višino zaradi omejenih območij in omejitev širjenja. Tu se o

Genetski in fenotipski vplivi na preživetje kopulacijskega čepa pri miših

Genetski in fenotipski vplivi na preživetje kopulacijskega čepa pri miših

Predmeti Evolucijska biologija Izvleček Moški semenske tekočine se med raznolikostjo živali koagulirajo ob ejakulaciji in tvori utrjeno strukturo, znano kot kopulacijski čep. Prejšnje študije kažejo, da so se kopulacijski čepi razvili kot mehanizem, da bi samci preprečili napredovanje samic, vendar manjkajo podrobne raziskave časovnega poteka čepov, ki preživijo v reproduktivnem traktu samice. Tu prestopi

Genske interakcije omejujejo potek evolucije odpornosti na fosfin v manjši zrnu, Rhyzopertha dominica

Genske interakcije omejujejo potek evolucije odpornosti na fosfin v manjši zrnu, Rhyzopertha dominica

Izvleček Fosfin, široko uporabljen fumigant za zaščito skladiščenega zrnja pred insekti škodljivci, ubija organizme posredno s sprožanjem oksidativnega stresa. V Aziji, Avstraliji in Južni Ameriki so odkrili visoke vrednosti dedne odpornosti na fosfin v škodljivcih žuželk, shranjenih v žitu, Rhyzopertha dominica . Da bi razum

Kratkoročne genetske posledice izgube habitata in razdrobljenosti za neotropsko dlan Oenocarpus bataua

Kratkoročne genetske posledice izgube habitata in razdrobljenosti za neotropsko dlan Oenocarpus bataua

Predmeti Strukturne variacije Izvleček Izguba in razdrobljenost habitata lahko vpliva na razpršitev semen in peloda, ki ga posredujejo živali, ključno vprašanje pa je, kako se genetski atributi rastlinskih populacij odzivajo na te spremembe. Teorija predvideva, da je genska raznolikost kratkoročno lahko manj občutljiva na takšne motnje, medtem ko se lahko križanci in genetska struktura odzovejo močneje. Vendar s

Genomika nezdružljivih dejavnikov in določanje spola pri hibridiziranih vrstah Cottusa (Ribe)

Genomika nezdružljivih dejavnikov in določanje spola pri hibridiziranih vrstah Cottusa (Ribe)

Predmeti Genomika Populacijska genetika Izvleček Cottus rhenanus in Cottus perifretum sta oblikovala hibridne rodove in ozke hibridne cone, ki jih je mogoče najbolje razložiti z dejanjem naravne selekcije. Vendar osnovne selektivne sile in njihovi genski cilji niso dobro razumljene. Ta študija identificira genske regije pri starševskih vrstah, ki povzročajo hibridne nezdružljivosti, in preizkuša, ali se ti manifestirajo na spolno specifičen način, da bi spoznali procese, ki vplivajo na naravno hibridizacijo v Cottusu . Interspe

Odziv na selekcijo in ugotovljeno dednost dolžine sperme pri rumeni muhi (Scathophaga stercoraria)

Odziv na selekcijo in ugotovljeno dednost dolžine sperme pri rumeni muhi (Scathophaga stercoraria)

Izvleček Dolžina sperme kaže na precejšnjo fenotipsko variacijo, tako inter- kot znotraj- specifično, vendar splošne razlage za to variacijo ni. Poleg tega je naše razumevanje genske variacije, ki temelji na spreminjanju dolžine sperme, omejeno tudi, ker je bilo malo študij o genetiki velikosti semenčic. Eden od

Povečanje zalog ali ujetje morja? Vpogled v spremljanje genske raznolikosti, sorodnosti in učinkovite velikosti populacije v semensko veliki populaciji drisk (Pecten maximus)

Povečanje zalog ali ujetje morja? Vpogled v spremljanje genske raznolikosti, sorodnosti in učinkovite velikosti populacije v semensko veliki populaciji drisk (Pecten maximus)

Predmeti Biotska raznovrstnost Populacijska genetika Izvleček Množično sproščanje staležev, ki se razmnožujejo valilnice, sproža številna vprašanja glede njegove učinkovitosti pri najemanju in vplivu na gensko raznolikost prostoživečih populacij. Program za sejanje, ki ga sestavljajo množično sproščanje mladic, ki se proizvajajo iz valilnice, v lokalni naraščajoči populaciji velikih lopov ( Pecten maximus L.), se je začel v za

Transkripcija heterokromatskih genov 5S rRNA je epigenetsko nadzorovana pri Arabidopsis thaliana in Xenopus laevis

Transkripcija heterokromatskih genov 5S rRNA je epigenetsko nadzorovana pri Arabidopsis thaliana in Xenopus laevis

Izvleček Ribosomska DNK 5S je zelo ohranjena tandemno ponovljena multigena družina. Kot že dolgo predlagamo, smo pokazali, da je v Arabidopsis thaliana izražen le del genov 5S rRNA . V Xenopus laevis obstaja razvojni nadzor ekspresije genov 5S rRNA z le eno od dveh družin 5S rDNA, izraženih med oogenezo. Tako

Ali morski ježki, ki vzrejajo valilnice, ogrožajo genetsko raznolikost divjih populacij?

Ali morski ježki, ki vzrejajo valilnice, ogrožajo genetsko raznolikost divjih populacij?

Predmeti Reja živali Populacijska genetika Izvleček Pri salmonidih se je pokazalo, da izpuščanje valilnih rib povzroča nepopravljive genetske vplive na prostoživeče populacije. Čeprav so odgovorne prakse za proizvodnjo in sproščanje gensko raznolikih mladoletnikov, ki so vzrejene valilnice, objavljene na široko, se le redko izvajajo. Tu smo ra

Učinki razpršene plastičnosti na razhajanje in določanje števila prebivalstva

Učinki razpršene plastičnosti na razhajanje in določanje števila prebivalstva

Predmeti Evolucijska teorija Strukturne variacije Izvleček Fenotipska plastičnost naj bi imela vlogo pri vzpostavljanju prebivalstva, lokalni prilagoditvi in ​​specifikaciji. Vendar pa je v tej literaturi razpršena plastičnost podcenjena. Plastičnost pri odločitvi o razpršitvi je taksonomsko razširjena in navajam primere za žuželke, mehkužce, polihete, vretenčarje in cvetoče rastline. Teoretično delo

Negativne fenotipske in genetske povezave med trajanjem kopulacije in dolgo življenjsko dobo moških semenskih hroščev

Negativne fenotipske in genetske povezave med trajanjem kopulacije in dolgo življenjsko dobo moških semenskih hroščev

Predmeti Študija genetske povezanosti Model nevretenčarjev Spolno vedenje Prvotni članek je bil objavljen 29. julija 2009 Popravek : dednost (2009) 103, 340–345; doi: 10.1038 / hdy.2009.80 Avtorji so odkrili napako, ki bi jo radi popravili. Tabela 1 prikazuje napačne vrednosti za koeficiente aditivne genske variacije (CV A ). Prav

Depresija inbreeding v urbanem okolju glivice ptičjega gnezda Cyathus stercoreus (Nidulariaceae: Basidiomycota)

Depresija inbreeding v urbanem okolju glivice ptičjega gnezda Cyathus stercoreus (Nidulariaceae: Basidiomycota)

Predmeti Glivice Inbreeding Populacijska genetika Izvleček Številni organizmi prikazujejo kodiziranje potomcev, manj pa prikazuje kodiziranost kompatibilnih gameta. Ta mehanizem povečuje sposobnost vrste, da se kolonizira po razpršitvi na dolge razdalje kot mehanizem zagotavljanja reprodukcije, hkrati pa spodbuja inbreeding in potencialno zmanjšanje kondicije. Tu

Učinkovitost genomske selekcije za oblikovanje plemenske populacije in napovedovanje fenotipa pri paradižniku

Učinkovitost genomske selekcije za oblikovanje plemenske populacije in napovedovanje fenotipa pri paradižniku

Predmeti Kmetijska genetika Reja rastlin Rastlinska genetika Izvleček Genska selekcija (GS), ki uporablja ocenjeni genetski potencial na podlagi podatkov o genotipu za vzrejni izbor, je danes splošno sprejeta kot učinkovita metoda za izboljšanje gensko zapletenih lastnosti. Ocenili smo potencial GS za povečanje vsebnosti topnih trdnih snovi in ​​skupne sadne mase paradižnika. Za izdel

Evolucijska in ekološka funkcionalna genomika

Evolucijska in ekološka funkcionalna genomika

Genomika, proteomika in sorodne tehnologije odkrivajo izjemne razlike v genih in njihovi ekspresiji, vendar so ta odkritja le začetek. Naslednji korak je odkrivanje, kako ta variacija vpliva na delovanje in kondicijo celih organizmov v populaciji. Skupaj z uveljavljenimi skupnostmi v biomedicinski in kmetijski funkcionalni genomiki se je oblikovala nova skupnost: evolucijska in ekološka funkcionalna genomika (EEFG), ki skuša razumeti funkcionalno podlago evolucijskih sil, ki oblikujejo ekološko pomembne lastnosti naravnih bioloških skupnosti. To

Razumevanje nedavne zgodovine kolonizacije rastlinske patogene glive z uporabo populacijskih genetskih orodij in Približno Bayesovo računanje

Razumevanje nedavne zgodovine kolonizacije rastlinske patogene glive z uporabo populacijskih genetskih orodij in Približno Bayesovo računanje

Predmeti Glivična biologija Gljivična patogeneza Populacijska genetika Izvleček Razumevanje procesov, s katerimi se nove bolezni uvajajo na prej zdravih območjih, je zelo pomembno pri pripravi politik preprečevanja in upravljanja, pa tudi pri razumevanju dinamike raznolikosti patogenov v velikem prostorskem obsegu. V t

Prepisni širok podpis hibridnega razpada, povezanega z lastno reproduktivno izolacijo parov v jezerskem sivu (Coregonus spp. Salmonidae)

Prepisni širok podpis hibridnega razpada, povezanega z lastno reproduktivno izolacijo parov v jezerskem sivu (Coregonus spp. Salmonidae)

Predmeti Razvojna biologija Genska regulacija Vzorčni vretenčarji Specifikacija Izvleček Genetske analize specifikacije so bile skoraj izključno osredotočene na retrospektivne analize reproduktivne izolacije med zelo različnimi vrstami. Kljub temu mora popolno razumevanje postopka specifikacije vključevati analizo posledic genske razhajanja v mladih rodovnikih, ki še vedno lahko izmenjujejo gene v naravnih pogojih. Kopiče

Obremenitev in krmljenje v križišču: posledice za kratkotrajno preživetje in ohranjanje majhnih populacij

Obremenitev in krmljenje v križišču: posledice za kratkotrajno preživetje in ohranjanje majhnih populacij

Predmeti Inbreeding Populacijska genetika Izvleček Z računalniškimi simulacijami ocenjujemo učinke genetskega čiščenja inbreeding obremenitve pri majhnih populacijah, ob predpostavki, da so genetski modeli škodljivih mutacij, ki empirično opazujejo značilno količino bremena. Naši rezultati kažejo, da genetsko čiščenje učinkovito odstrani obremenitev inbredingov tako letalnih kot nesmrtnih mutacij, s čimer zmanjša količino depresije inbridiranja v primerjavi s pričakovano brez izbire. Ugotavljamo, da je

Ontogenetske spremembe genetskih sprememb plastičnosti, odvisne od starosti, vzdolž širinskega gradienta

Ontogenetske spremembe genetskih sprememb plastičnosti, odvisne od starosti, vzdolž širinskega gradienta

Predmeti Evolucijska genetika Izvleček Izraženost fenotipske plastičnosti se lahko med življenjskimi fazami istega organizma razlikuje. Starostno odvisna plastičnost je lahko pomembna za prilagajanje heterogenim okoljem, vendar je to šele pred kratkim prepoznano. Ali je plastičnost, odvisna od starosti, pogost rezultat lokalne prilagoditve in ali populacije v tem pogledu zajemajo genske variacije, ostaja v glavnem neznano. Da bi

Relativni učinki segregacije in rekombinacije na evolucijo spola v omejenih diploidnih populacijah

Relativni učinki segregacije in rekombinacije na evolucijo spola v omejenih diploidnih populacijah

Predmeti Evolucijska genetika Izvleček Mehanizem razmnoževanja bolj sposobnih potomcev kot odziv na izbiro je glavni dejavnik, ki vpliva na prednosti seksa. Pri diploidih spolno razmnoževanje združuje genotip z rekombinacijo in segregacijo. Teoretične študije spolne reprodukcije so preučile prednost rekombinacije pri haploidih. Venda

Napovedovanje hibridnih lastnosti riža z uporabo univarijatnih in multivariatnih GBLUP modelov, ki temeljijo na paritvenem dizajnu II v Severni Karolini

Napovedovanje hibridnih lastnosti riža z uporabo univarijatnih in multivariatnih GBLUP modelov, ki temeljijo na paritvenem dizajnu II v Severni Karolini

Predmeti Reja rastlin Izvleček Genomska selekcija (GS) je v hibridni reji bolj učinkovita kot tradicionalne metode, ki temeljijo na fenotipu. Ta študija je preučevala napovedno sposobnost genomskih najboljših linearnih nepristranskih modelov napovedovanja hibridov riža, ki temeljijo na paritvenem oblikovanju II v Severni Karolini, v katerem je bilo skupaj 115 inbred riževih linij prekriženih s 5 moškimi sterilnimi linijami. Z upora

Ugotovitev mešanja večvalnega prebivalstva z modeliranjem razpadanja neravnovesja povezave s polinomnimi funkcijami

Ugotovitev mešanja večvalnega prebivalstva z modeliranjem razpadanja neravnovesja povezave s polinomnimi funkcijami

Predmeti Populacijska genetika Izvleček Za sklep o zgodovini primesi prebivalstva je pomemben izziv z metodami, ki temeljijo na neravnovesju med primesi povezave (ALD), odstraniti učinek izvorne LD (SLD), ki je neposredno podedovana iz izvornih populacij. V prejšnjih metodah je bila za sklepanje o nedavnih primesi z enim ali več valovi nameščena le krivulja razpada tehtanega LD med pari mest, katerih genetska razdalja je bila večja od določene izhodne razdalje. Vendar

Grozdanje prebivalstva in klonska struktura dokazujeta stanje relikvije Ulmus minor Mill. na Balearskih otokih

Grozdanje prebivalstva in klonska struktura dokazujeta stanje relikvije Ulmus minor Mill. na Balearskih otokih

Predmeti Konzervacijska biologija Ekologija rastlin Populacijska genetika Izvleček Poljski brijest ( Ulmus minor ) je obrežno drevo, ki raste v redkih, majhnih populacijah, raztresenih po začasnih vodotokih na Balearskih otokih, ki so danes večinoma pokriti s sredozemskim rastlinjem. Kmetijstvo in kmetovanje na rodovitnih zemljiščih ob občasno poplavljenih ravnicah je zmanjšalo populacijo brijesti na redke drevesne črte vzdolž struge. Prisotno

Ocena zanesljivosti kvantitativnih ocen genetike v študijskih sistemih z visoko hitrostjo razmnoževanja zunaj para in nizkim rekrutiranjem

Ocena zanesljivosti kvantitativnih ocen genetike v študijskih sistemih z visoko hitrostjo razmnoževanja zunaj para in nizkim rekrutiranjem

Predmeti Evolucijska genetika Izvleček Kvantitativni pristopi genetike, zlasti živalskih modelov, se pogosto uporabljajo za ocenjevanje genetske (so) variance ključnih lastnosti, povezanih s fitnesom, in sklepanja o prilagodljivem potencialu divjih populacij. Kljub pomembnosti natančnosti in natančnosti ocen genetske variance in njihove potencialne občutljivosti na različne ekološke in populacijske specifične dejavnike je njihova zanesljivost le redko izrecno preizkušena. Tu smo u

Kartiranje genetskih lokusov, ki vplivajo na miostatin, da vplivajo na rastne lastnosti

Kartiranje genetskih lokusov, ki vplivajo na miostatin, da vplivajo na rastne lastnosti

Predmeti Gensko kartiranje Kvantitativni lokusi lastnosti Izvleček Myostatin ali GDF8 je zaviralec rasti skeletnih mišic. Nefunkcionalna mutacija miostatina pri nekaterih vrstah, na primer miši, govedo in človek, privede do dvojnega mišičastega fenotipa. Prejšnje študije so pokazale, da v genomu obstajajo lokusi, ki medsebojno delujejo z miostatinom za nadzor globine maščob in drugih zapletenih lastnosti. Zdaj por

Otoki specifikacije ali mirage v puščavi? Preučitev vloge omejene rekombinacije pri ohranjanju vrst

Otoki specifikacije ali mirage v puščavi? Preučitev vloge omejene rekombinacije pri ohranjanju vrst

Predmeti Rekombinacija DNA Specifikacija Prvotni članek je bil objavljen 18. novembra 2009 Popravek: dednost (2009) 103 , 434–444; doi: 10.1038 / hdy2009.151 Avtorji so že od objave tega prispevka opazili, da so v Turner in sod. (2005) na strani 440 in nato na strani 441 „vsaka od zgoraj omenjenih empiričnih študij je ta vzorec vsaj deloma dokumentirala z uporabo relativnih ukrepov razhajanja, kot sta F ST in Da in interpretirana v okviru regij z nizko rekombinacijo, ki olajšajo razhajanje vrst ob prisotnosti genskega pretoka. "

Komponente genske variance in dednost večjezične heteroroznosti pri križanju

Komponente genske variance in dednost večjezične heteroroznosti pri križanju

Predmeti Evolucijska genetika Izvleček Vzdrževanje genske raznolikosti v lastnostih, povezanih s fitnesom, ostaja osrednja tema v evolucijski biologiji, na primer v okviru spolnega izbora za genetske koristi. Med predlaganimi rešitvami je usmerjena spolna izbira za heterozigotičnost. O pomenu take izbire je zelo razpravljalo. Kl

Reproduktivna aktivnost sproži pospešeno umrljivost moških in zmanjšuje življenjsko dobo: genetske in genetske ekspresije v Drosophili

Reproduktivna aktivnost sproži pospešeno umrljivost moških in zmanjšuje življenjsko dobo: genetske in genetske ekspresije v Drosophili

Predmeti Evolucijska genetika Genetika Izvleček Razmnoževanje in staranje sta se razvila, da bi bila tesno povezana. Eksperimentalna selekcija za reprodukcijo v zgodnjem življenju povzroča razvoj zmanjšane dolgoživosti drosophile, medtem ko eksperimentalna selekcija za povečano dolgo življenjsko dobo vodi do sprememb v razmnoževanju. Čeprav

Debricijska depresija pri dvosmernih populacijah rastline Mercurialis annua: primerjave med preseženim potomstvom in potomstvom samoplodnih feminiziranih samcev

Debricijska depresija pri dvosmernih populacijah rastline Mercurialis annua: primerjave med preseženim potomstvom in potomstvom samoplodnih feminiziranih samcev

Izvleček Debelost pri krčenju je ključni dejavnik pri vzdrževanju ločenih spolov v rastlinah z izbiro za preprečevanje samoplodnosti. Vendar pa je o stopnjah debeline inbreeding pri dvorodnih vrstah znano zelo malo, očitno zato, ker je samce ali samice težko samoploditi. Te težave smo premagali tako, da smo klonično razmnoževali samce iz rodov v dvosmerni metapopulaciji evropske letne rastline Mercurialis annua , feminizirali nekatere od njih in križali feminizirane z neomejenimi kloni. S to metod

Kako debel je rep?

Kako debel je rep?

Razprševanje semena in cvetnega prahu sta ključna parametra pri oblikovanju dinamike in razvoja rastlinskih populacij, saj vplivata tako na kolonizacijske procese kot na genske izmenjave med posamezniki. Naše znanje o razdalji, ki jo prečkajo semena ali cvetni prah, se je v zadnjih dveh desetletjih močno izboljšalo z uporabo visoko polimorfnih molekularnih markerjev, kot so mikrosateliti (Smouse in Sork, 2004). Z uj

Večkratna uvedba divergentnih genetskih linij v invazivnem glivičnem patogenu, Cryphonectria parasitica, v Franciji

Večkratna uvedba divergentnih genetskih linij v invazivnem glivičnem patogenu, Cryphonectria parasitica, v Franciji

Izvleček Pojav večkratnih vnosov je lahko ključni dejavnik uspešne vzpostavitve invazivnih vrst, vendar se le malo raziskav osredotoča na vnos glivičnih patogenov, kljub pomembnemu vplivu na okužene habitate. Čeprav je bila glivica Cryphonectria parasitica , ki je bila v 20. stoletju v Severni Ameriki in Evropi iz Azije v Severni Ameriki in Evropi, povzročila dramatične spremembe na svojem novem območju, zgodovina njene uvedbe v Evropi ni dovolj raztegnjena. Z 10 mikr

Evolucijska študija potencialne selektivne ciljne regije pri prašiču

Evolucijska študija potencialne selektivne ciljne regije pri prašiču

Predmeti Genska variacija Vzorčni vretenčarji Molekularna evolucija Kvantitativni lokusi lastnosti Izvleček Udomačitev, sodobna reja in umetna selekcija so dramatično oblikovali gensko spremenljivost domačih živali. V živinoreji je bil tako imenovani kvantitativni lokus FAT1 (QTL) v prašičjem kromosomu 4 prvi odkrit QTL, čeprav do danes njegova natančna molekularna narava še vedno ni bila znana. Tu označuje

Ocenjevanje sodobne učinkovite velikosti populacije pri ne-modelnih vrstah z uporabo neenakomernosti povezav na tisoče lokusov

Ocenjevanje sodobne učinkovite velikosti populacije pri ne-modelnih vrstah z uporabo neenakomernosti povezav na tisoče lokusov

Predmeti Genska variacija Genomika Populacijska genetika Izvleček Sodobno učinkovito velikost populacije ( N e ) je mogoče oceniti z uporabo neravnovesja vezi (LD), opaženega v parih lokusov, za katere se domneva, da so selektivno nevtralni in nepovezani. Ta metoda se pogosto uporablja za nabore podatkov, ki vsebujejo 10–100 lokusov za obveščanje o ohranjanju in preučevanju demografije prebivalstva. Učinkov

Filogeografski dokazi za dve mesični refigi v žarišču biotske raznovrstnosti

Filogeografski dokazi za dve mesični refigi v žarišču biotske raznovrstnosti

Predmeti Biotska raznovrstnost Biogeografija Rastlinska genetika Populacijska genetika Izvleček Filogeografske študije flore v vrstah, bogatih z vrstami v jugozahodni Avstraliji, kažejo na kompleksne evolucijske zgodovine, ki odražajo vzorce obstojnosti in odpornosti na klimatske spremembe med pleistocenom. Vp

Prilagodljiva divergenca v okolju z visokim pretokom genov: variacija Hsc70 v Evropski jagodičnici (Platichthys flesus L.)

Prilagodljiva divergenca v okolju z visokim pretokom genov: variacija Hsc70 v Evropski jagodičnici (Platichthys flesus L.)

Izvleček O lokalnih prilagoditvah morskih rib je malo znanega, saj populacijske genetske raziskave pri teh vrstah običajno ne uporabljajo genetskih markerjev, ki bi bili predmet selekcije. V tej raziskavi smo uporabili pristop genskega pristopa, da smo raziskovali prilagodljivo divergenco populacije v evropski jati ( Platichthys flesus L.)

Črniči, okrašeni v prirodi, kažejo višje ukrepe za makroparazitsko imunost kot iztrebljeni posamezniki

Črniči, okrašeni v prirodi, kažejo višje ukrepe za makroparazitsko imunost kot iztrebljeni posamezniki

Predmeti Genetika Imunologija Inbreeding Izvleček Domneva se, da negativni učinki negativno vplivajo na kondicijo, vključno z zmanjšano sposobnostjo, da se vzdrži imunskih izzivov. Preučili smo imunološke posledice križanja pri okrašenih čričkih , Gryllodes sigillatus , s primerjavo litske aktivnosti, aktivnosti fenoloksidaze (PO) in sposobnosti inkapsulacije čričkov iz osmih inbredov s posledicami čričkov iz populacije ustanoviteljev. Presenetljivo

Uporaba večih označevalcev kaže na kriptičen zahodni odpadki in postglacialne kolonizacijske poti atlantskega lososa (Salmo salar L.) na severozahodu Evrope

Uporaba večih označevalcev kaže na kriptičen zahodni odpadki in postglacialne kolonizacijske poti atlantskega lososa (Salmo salar L.) na severozahodu Evrope

Predmeti Genetski markerji Genska variacija Izvleček Znani so, da so ledeniški in postglacialni procesi pomembni dejavniki sodobnega strukturiranja populacij za številne vrste. V Evropi velja, da so refogija na italijanskem, balkanskem in Iberskem polotoku glavni viri vrst, ki kolonizirajo severno Evropo po ledeniškem umikanju; vendar je vse več dokazov o majhnih, kriptičnih refozijah, ki obstajajo severno od teh za številne hladno prenašajoče se vrste. Ta štud

Pomanjkanje heterozigote v populaciji parazitov: ocena medsebojno povezanih hipotez v rakunskem klopu, Ixodes texanus

Pomanjkanje heterozigote v populaciji parazitov: ocena medsebojno povezanih hipotez v rakunskem klopu, Ixodes texanus

Predmeti Model nevretenčarjev Parazitska biologija Populacijska genetika Izvleček Populacijska genetika se vse pogosteje uporablja za proučevanje biologije parazitov na lestvicah gostitelja (infrapopulacija, IP) in populacije gostiteljev (komponentna populacija, CP). V tej raziskavi smo preizkusili tri mehanične hipoteze, ki bi lahko razložile odstopanja od pričakovanj o ravnotežju Hardy-Weinberga (HWE) zaradi pomanjkanja heterozygote (HD) na lestvici CP v rakunskih klopih ( Ixodes texanus ; n = 718), zbranih iz rakunov ( Procyon lotor ; n = 91) in genotipizirano pri 11 mikrosatelitskih lokusih

Genomski vtis: teorije in podatki

Genomski vtis: teorije in podatki

Predmeti Imprinting William Bateson, eden od očetov mendeljske genetike, je v svojem uvodnem profesorskem predavanju na Cambridgeu študentom nove znanosti opozoril: Če lahko začetnikom vrnem kakšno svetovalno besedo, je to: začnite svoje izjeme! . Naj bodo vedno nepokrite in na vidiku. Izjeme so podobne grobi opečni opeki rastoče stavbe, ki pove, da je treba še veliko in kaže, kje naj bo naslednja gradnja. (Bateson

Spremembe lastnosti, povezanih s fitnesom, zaradi zlaganja transgenih odpornosti na glifosat in odpornosti na žuželke v Brassica napus L.

Spremembe lastnosti, povezanih s fitnesom, zaradi zlaganja transgenih odpornosti na glifosat in odpornosti na žuželke v Brassica napus L.

Predmeti Kmetijska genetika Ekologija rastlin Odzivi na rastlinski stres Izvleček Vse pogosteje se razvijajo gensko spremenjene rastline, ki izražajo več "zloženih" lastnosti različnih vrst transgenov, na primer odpornost na herbicide, odpornost na žuželke, kakovost pridelka in toleranco na okoljske obremenitve. Sproš

Ponovno sekvenciranje ne-modelnih organizmov s celotnim genomom: lekcije iz belih vzorcev

Ponovno sekvenciranje ne-modelnih organizmov s celotnim genomom: lekcije iz belih vzorcev

Predmeti Gensko kartiranje Naslednje generacije Rastlinska genetika Izvleček Nepopisani odčitki se pogosto zavržejo z analizo ponovnega sekvenciranja celotnega genoma, vendar se z njihovo analizo lahko odkrijejo nove biološke informacije in vpogledi. V tem prispevku raziskujemo neopisane odčitke iz podatkov o ponovnem zaporedju 33 genov grahove listne uši posameznikov, specializiranih za različne gostiteljske rastline. Nenap

Povečana inbreeding in močna sorodstvena struktura v bakteriji Taxus ocenjujejo tako podatki AFLP kot SSR

Povečana inbreeding in močna sorodstvena struktura v bakteriji Taxus ocenjujejo tako podatki AFLP kot SSR

Predmeti Inbreeding Naravna variacija rastlin Populacijska genetika Izvleček Razdrobljenost habitata ima lahko hude genetske posledice za drevesa, kot sta povečano križanje in manjša učinkovita populacija. Dejansko lokalna populacija trpi zaradi zmanjšanja genske variacije in s tem izgube sposobnosti prilagajanja, kar posledično poveča tveganje za izumrtje. V Evro

Učinkovita velikost prebivalstva v ekologiji in evoluciji

Učinkovita velikost prebivalstva v ekologiji in evoluciji

Predmeti Evolucijska teorija Dinamika prebivalstva Populacijska genetika Učinkovita velikost populacije ( N e ) je eden najpomembnejših parametrov v populacijski genetiki in ohranjanju biologije. Velikosti popisov dejanske populacije prevede v velikost idealizirane populacije, ki kaže enako stopnjo izgube genske raznolikosti kot realna preiskovana populacija. L

Filologeografski vzorec širjenja območja ponuja dokaze o kriptičnih vrstah vrst Silene nutanov v zahodni Evropi

Filologeografski vzorec širjenja območja ponuja dokaze o kriptičnih vrstah vrst Silene nutanov v zahodni Evropi

Predmeti Ekologija Populacijska genetika Izvleček Kot rezultat nedavnih ali preteklih evolucijskih procesov bi lahko ena vrsta sestavljala ločene evolucijsko pomembne enote (ESU), ki bi ustrezale celo kriptičnim vrstam. Določitev osnovnih mehanizmov premikov območja in procesov, ki delujejo pri nabiranju različnih diverzantskih enot, zahteva razjasnitev dejavnikov, ki prispevajo k genetski razliki populacije v celotnem območju vrste. Razis

Kromosomski neenakomernost vezi, ki jo povzroči inverzijski polimorfizem vrabca z belim grlom (Zonotrichia albicollis)

Kromosomski neenakomernost vezi, ki jo povzroči inverzijski polimorfizem vrabca z belim grlom (Zonotrichia albicollis)

Predmeti Genska variacija Vzorčni vretenčarji Molekularna evolucija Izvleček Kromosomske inverzije so že dolgo zanimive za genetike, ker lahko zavirajo rekombinacijo in olajšajo nastanek adaptivnih genskih kompleksov. Izjemen inverzijski polimorfizem (ZAL2 m ) pri vrabcu z belim grlom ( Zonotrichia albicollis ) je povezan z variacijo propadanja , družbenega vedenja in izbiro mate in se v populaciji vzdržuje z negativnim asortativnim parjenjem. Polim

Dinamika populacije in hitro širjenje kardinija, bakterijskega endosimbionta, ki povzroča nezdružljivost citoplazme pri Encarsia pergandiella (Hymenoptera: Aphelinidae)

Dinamika populacije in hitro širjenje kardinija, bakterijskega endosimbionta, ki povzroča nezdružljivost citoplazme pri Encarsia pergandiella (Hymenoptera: Aphelinidae)

Izvleček Citoplazmatska nezdružljivost (CI) je pogost fenotip materinsko podedovanih bakterijskih simbiontov členonožcev; V svojem najpreprostejšem izražanju neokužene samice pri paru z okuženimi samci ustvarijo malo ali sploh nobenega potomstva. Okužene samice imajo torej reproduktivno prednost v primerjavi z neokuženimi samicami, pri čemer se lahko simbiont hitro širi. Dinamika p

Prenosni elementi v zarodnih sesalcih: udobna niša ali smrtonosna past?

Prenosni elementi v zarodnih sesalcih: udobna niša ali smrtonosna past?

Predmeti Metilacija DNA Prenosljivi elementi DNK Razvoj zarodkov RNK Pivi Izvleček Retrotranspojivi elementi sestavljajo približno 50% genoma sesalcev. Njihova dejavnost predstavlja nenehno grožnjo gostitelju in je spodbudila razvoj prilagodljivih nadzornih mehanizmov za zaščito arhitekture in delovanja genoma. Da

Kmetje brez meja - gensko strukturiranje v stoletnem ječmenu (Hordeum vulgare)

Kmetje brez meja - gensko strukturiranje v stoletnem ječmenu (Hordeum vulgare)

Predmeti Kmetijska genetika Biogeografija Populacijska genetika Izvleček Geografska porazdelitev genske raznolikosti lahko razkrije evolucijsko zgodovino vrste. Pri poljščinah filogeografski vzorci kažejo tudi na izmenjavo in širjenje semena v agrarnih skupnostih. Takšne vzorce pa zlahka zamegli intenzivna trgovina s semeni, izboljšanje rastlin in celo ohranjanje genskih bank v dvajsetem stoletju, zato je prepoznavanje drobnih filogeografskih vzorcev še posebej zahtevno. Z zgod