Kemijska biologija (April 2020)

Alosterična inhibicija faktorja 2, ki povzroča hipoksijo, z majhnimi molekulami

Alosterična inhibicija faktorja 2, ki povzroča hipoksijo, z majhnimi molekulami

Predmeti Biokemija Biofizika Rak Kemična orodja Pregledi z visoko prepustnostjo Majhne molekule Izvleček Faktorji, ki so inducirani s hipoksijo (HIF), so heterodimerni transkripcijski faktorji, ki se sprožijo pri številnih rakih, kjer pogosto spodbujajo izražanje protumorigenskih poti. Čeprav se faktorji transkripcije običajno štejejo za "nezdružljiv", domena PAS-B podenote HIF-2α vsebuje veliko votlino v svojem hidrofobnem jedru, ki ponuja edinstveno oporo za regulacijo majhnih molekul. Tu prepo

Kiralna cikloaddicija

Kiralna cikloaddicija

Predmeti Reakcijski mehanizmi Kemijska sinteza Angew. Chem. Int. Ed. 51 , 1248–1251 (2012) Domino reakcije ponujajo lahek dostop do zapletenih molekulskih arhitektur, pogosto z izvrstnim stereokemičnim nadzorom. Shi et al . dajte eleganten primer tega pristopa v novi [2 + 2 + 2] cikloaddition reakciji, ki združuje Michaelove in Henryjeve reakcije za dostop do cikloheksanskega izdelka s stereokemično določenimi substituenti pri vsakem ogljiku v obroču. Avtor

Intenini pod oblogami

Intenini pod oblogami

Predmeti Poškodba in popravilo DNK Encimski mehanizmi Post-translacijske spremembe Napovedi strukture beljakovin Nukleinske kisline Res. doi: 10.1093 / nar / gkv612 Inteini so samoplastični elementi, ki se izločijo iz prevedenih beljakovin, da za seboj puščajo ekstenzin ali zreli protein. Šteje se, da je večina funkcionalno ustreznih ostankov notranjih za celoto, čeprav je bilo dokazano, da nekaj ostankov v sekvenčni sekvenci, ki neposredno mejijo na intein, vplivajo na delovanje. Za neka

Minimalne informacije o grozdu biosintetike

Minimalne informacije o grozdu biosintetike

Predmeti Biosinteza Naravni izdelki Opomba o zaporedju Sintetična biologija Znano je, da je široka paleta encimskih poti, ki proizvajajo specializirane presnovke v bakterijah, glivah in rastlinah, zakodirana v biosintetskih grozdih. Informacije o teh grozdih, poteh in presnovkih so trenutno razpršene po vsej literaturi, kar otežuje njihovo izkoriščanje. Da b

Mobiliziranje peptidov v imunosti

Mobiliziranje peptidov v imunosti

Predmeti Imunologija Peptidi Uporabo imunskega sistema za zdravljenje bolezni bo olajšalo večje razumevanje izvora in vloge peptidov v imunosti. Že več kot 30 let je znano, da so peptidi kritični dejavniki pri mobilizaciji imunskega sistema pred tujimi napadalci. Od takrat nova znanja o tvorbi in delovanju peptidov v imunologiji podpirajo prizadevanja za uporabo imunskega sistema za zdravljenje bolezni. Klj

Napaka: Aminoglikozidna aktivnost, opažena na posameznih kompleksih pred translokacijo ribosomov

Napaka: Aminoglikozidna aktivnost, opažena na posameznih kompleksih pred translokacijo ribosomov

Predmeti Mehanizem delovanja Ribosome Strukturna biologija tRNA Prvotni članek je bil objavljen 29. novembra 2009 Nat. Chem. Biol. 6 , 54–62 (2010); objavljeno na spletu 29. novembra 2009; popravljeno po tisku 12. februarja 2010 V različici tega članka, ki je bila prvotno objavljena v ključu za sliko 6a, so bile enote za dve koncentraciji zaviralcev napačno označene kot "M", kjer bi morale biti prebrane "µM". Napaka

Napaka: Vpogled v mukopolisaharidozo I iz strukture in delovanja α-L -iduronidaze

Napaka: Vpogled v mukopolisaharidozo I iz strukture in delovanja α-L -iduronidaze

Predmeti Kemijska biologija Presnovne motnje Strukturna biologija Prvotni članek je bil objavljen 11. septembra 2013 Nat. Chem. Biol. ; doi: 10.1038 / nchembio.1357; popravljeno na spletu 20. septembra 2013 V različici tega članka, ki je bil prvotno objavljen na spletu v razdelku o metodah »Sintetizirani zaviralci IDUA«, sta bili za 5F-IdoAF navedeni dve različni kemijski imeni, popolno ime za 2F-IdoAF pa je bilo nenamerno izpuščeno. Poleg

Popravek: Molekularno slikanje vodikovega peroksida za celično signalizacijo

Popravek: Molekularno slikanje vodikovega peroksida za celično signalizacijo

Prvotni članek je bil objavljen 1. aprila 2007 Nature Chemical Biology 3 , 263–267 (2007); objavljeno na spletu 1. aprila 2007; popravljeno po tisku 3. maja 2007 V prvotno objavljeni različici članka je priimek drugega avtorja napačno črkovan. Ime avtorja naj glasi Orapim Tulyathan. Napaka je bila odpravljena v različicah članka HTML in PDF. Avtorji

Popravek: Reverzibilno reprogramiranje celične življenjske dobe na osnovi majhnih molekul

Popravek: Reverzibilno reprogramiranje celične življenjske dobe na osnovi majhnih molekul

Nature Chemical Biology 2 , 369–374 (2006); objavljeno na spletu 11. junija 2006; popravljeno po tisku 22. decembra 2006 V prvotno objavljeni različici tega članka niso bili navedeni nobeni konkurenčni finančni interesi. Avtorji zdaj izjavljajo, da imajo konkurenčne interese, za katere je mogoče, da bi vplivali na rezultate in razprave, poročene v tem dokumentu, ki so podrobno opredeljeni v izjavi o konkurenčnih finančnih interesih, ki je priložena članku. Napaka je b

Popravek: Modulatorji spajanja SMN2 izboljšajo povezavo U1-pred-mRNA in rešijo SMA miši

Popravek: Modulatorji spajanja SMN2 izboljšajo povezavo U1-pred-mRNA in rešijo SMA miši

Prvotni članek je bil objavljen 01. junija 2015 Nat. Chem. Biol. 11 , 511–517 (2015); objavljeno na spletu 1. junija 2015; popravljeno na spletu 15. julija 2015 Avtorji so pozabili vključiti opis merjenja ravni beljakovin SMN v vzorcih tkiv v Spletne metode. Ta opis je vključen v različici članka HTML in PDF. Avtor

Zajemanje kooperativnosti

Zajemanje kooperativnosti

Upoštevanje skupnih definicij in mehanizmov sodelovalnega vedenja lahko privede do novega vpogleda v kemijsko in biološko delovanje. Kooperativnost je dobro znana kot energijska podlaga za številne mikroskopske dogodke, kot so hkratno keliranje kovinskih ionov, časovna koordinacija zlaganja beljakovin in usklajena funkcija biomolekularnih sklopov. Za

Vetrovnik za RNA

Vetrovnik za RNA

Dve Nobelovi nagradi za leto 2006 odražata osrednjo vlogo RNA pri uravnavanju genov in poudarjata medsebojno delovanje odkritij v kemiji in biologiji. RNA je vidno poudarila vrsto nedavnih prelomnih odkritij. Decembra 2006 je Nobelov odbor priznal dva takšna napredka, ko je Rogerju Kornbergu podelil Nobelovo nagrado za kemijo za njegovo delo na razjasnitvi molekularnih mehanizmov prepisovanja RNA in Nobelovi nagradi za fiziologijo ali medicino Craigu Mellou in Andreju Fireju za njihovo odkritje interference RNA (RNAi).

Popravek: Dinamika prepoznavanje substrata s katalizo v protein kinazi A

Popravek: Dinamika prepoznavanje substrata s katalizo v protein kinazi A

Predmeti Encimski mehanizmi Kinaze Molekularna konformacija Prvotni članek je bil objavljen 03. oktobra 2010 Nat. Chem. Biol. 6 , 821–828 (2010); objavljeno na spletu 3. oktobra 2010; popravljeno po tisku 18. aprila 2011 V prvotno objavljeni različici so avtorji napačno priznali sredstva ameriškega Nacionalnega inštituta za zdravje GM64742. Pravi

Precej pripomb

Precej pripomb

Predmeti Kemijska biologija Založništvo Znanstveniki morajo biti pozorni, da zagotovijo celovitost objavljenega zapisa in poiščejo nove načine za lažjo znanstveno razpravo v elektronski dobi. V naši dobi ažurnega poročanja in družbenih omrežij novo objavljena znanstvena odkritja - zlasti tista, ki se pojavljajo v odmevnih revijah - dosegajo večjo znanstveno publiko in širšo javnost z večjo učinkovitostjo. Vendar pa se t

Napaka: Endoplazemski retikulum Ca2 + poveča povečanje mutantne glukocerebrosidazne proteostaze

Napaka: Endoplazemski retikulum Ca2 + poveča povečanje mutantne glukocerebrosidazne proteostaze

Predmeti Kalcijeva signalizacija Endoplazemski retikulum Presnovne bolezni Izvirni članek je bil objavljen 9. maja 2010 Nat. Chem. Biol. 6 , 424–432 (2010); objavljeno na spletu 9. maja 2010; popravljeno po tisku 21. maja 2010. V prvotno objavljeni različici tega članka je bila ena od uporabljenih celičnih linij napačno imenovana mutantna oznaka L444P v zvezi s sliko 6a, druga celična linija pa tega poimenovanja ni vključevala glede na dodatno sliko 11a, b. Napake

Široko odprte oči

Široko odprte oči

Razumevanje delovanja beljakovin izolirano in v domačem kontekstu zahteva združitev tehnik na molekularni ravni, ki raziskujejo medsebojno delovanje in dinamiko beljakovin. Pojma "en gen, en encim" in "struktura določa funkcijo" sta osnovna načela sodobne biokemije. K temu dodajte še idejo, da so organizmi stroji, ki jih je mogoče razumeti kot seštevek njihovih delov, in vi imate redukcionistično stališče, ki zajema implicitno hierarhijo fizike, ki vlada kemijo in kemijo vladajočo biologijo. Vendar je

Popravek: Boj proti nevrodegenerativni bolezni s kemičnimi sondami in modelnimi sistemi

Popravek: Boj proti nevrodegenerativni bolezni s kemičnimi sondami in modelnimi sistemi

Predmeti Biološki modeli Kemijska biologija Nevrodegenerativne bolezni Terapevtiki Nat. Chem. Biol. 10 , 911–920 (2014); objavljeno na spletu 17. oktobra 2014; popravljeno po tisku 11. decembra 2014 V prvotno objavljeni različici prispevka je bil fazni vnos za PBT2 v preglednici 1 nenamerno označen kot „Prenehano“. Zdaj je

Zmanjšanje pravih ciljev

Zmanjšanje pravih ciljev

Predmeti Kemijska genetika Proteomics Identifikacija cilja Mnogi zaviralci kinaze za zdravljenje raka so precej neselektivni, njihovi celični mehanizmi delovanja pa so nepopolno razumljeni. Gnezdena strategija kemične proteomike in kemijske genetike razkriva, katere celične tarče zaviralca kliničnega kinaze dasatinib se funkcionalno nanašajo na njegovo anti-onkogeno delovanje. Dere

Dajanje podatkov v delo

Dajanje podatkov v delo

Predmeti Baze podatkov Genomika Znanstvena skupnost Za optimalno uporabo obsežnih podatkovnih nizov, ki se ustvarjajo v obdobju po genomu, bodo potrebni jasni standardi in zaveza do odprte komunikacije. Kemiki in biologi že tradicionalno napredujejo znanost z opredelitvijo določenega zanimivega sistema, oblikujejo modele za delovanje sistema in testirajo te modele na naraščajoči ravni molekularne ločljivosti. Priho

Spodnja črta

Spodnja črta

Okrepljena podpora za financiranje in povečana udeležba kemičnih biologov v procesu financiranja sta ključnega pomena za napredek na tem področju. V najboljših časih se akademski znanstveniki soočajo z izzivi pri pridobivanju sredstev za podporo svojih neodvisnih raziskovalnih prizadevanj. To niso najboljši časi. Nedavni

Kaj je v pregledu?

Kaj je v pregledu?

Predmeti Kemijska biologija Medsebojni pregled Znanstveni sodniki sprejemajo kritično vlogo v postopku strokovnega pregleda. Kaj pričakujemo od pregledovalcev Nature Chemical Biology ? Medsebojni pregled ostaja glavni mehanizem za vzdrževanje visokih standardov in zagotavljanje popolnosti in natančnosti znanstvenih študij. Avt

Iskanje sebe

Iskanje sebe

Predmeti Založništvo Zagotavljanje, da so vaši raziskovalni dosežki in interesi dostopni na spletu, širi doseg vašega znanstvenega dela. Znanstveno založništvo je postalo sinonim za znanstveno raziskovanje, saj zagotavlja mehanizem za izmenjavo odkritij in hipotez ter za navdih prihodnjih prizadevanj. Vendar

Errata: nenehna usmerjena evolucija sintetaz aminoacil-tRNA

Errata: nenehna usmerjena evolucija sintetaz aminoacil-tRNA

Prvotni članek je bil objavljen 16. oktobra 2017 Nat. Chem. Biol. 13 , 1253–1260 (2017); objavljeno na spletu 16. oktobra 2017; popravljeno po tisku 1. decembra 2017 V prvotno objavljeni različici članka so bile prenesene barve nalepk za p -NF in p -IF v ključu za sliko 4c. Cijanske palice bi morale ustrezati p -NF, fuksije pa p -IF. Napa

Popravek: Arginin-ramnozilacija kot nova strategija za aktiviranje faktorja podaljšanja prevajanja P

Popravek: Arginin-ramnozilacija kot nova strategija za aktiviranje faktorja podaljšanja prevajanja P

Izvirni članek je bil objavljen 16. februarja 2015 Nat. Chem. Biol. ; doi: 10.1038 / nchembio.1751; popravljeno na spletu 24. februarja 2015 V različici tega članka, ki je bila prvotno objavljena na spletu, je bil nenamerno izpuščen srednji začetnik drugega avtorja. Napaka je bila odpravljena za tiskano, PDF in HTML različico tega članka. Avtorj

Popravek: Alosterni peptidi vežejo zimogen kaspaze in posredujejo tetramerizacijo kaspaze

Popravek: Alosterni peptidi vežejo zimogen kaspaze in posredujejo tetramerizacijo kaspaze

Predmeti Pregled drog Encimski mehanizmi Nevrodegenerativne bolezni Strukturna biologija Prvotni članek je bil objavljen 10. junija 2012 Nat. Chem. Biol. 8 , 655–660 (2012); objavljeno na spletu 10. junija 2012; popravljeno po tisku 21. maja 2013 V prvotno objavljeni različici članka je bila Irina Krilova nenamerno priznana in ne uvrščena na seznam avtorjev. Sezna