Povezava kartice 8 z vnetno črevesno boleznijo pri Korejah | časopis za človeško genetiko

Povezava kartice 8 z vnetno črevesno boleznijo pri Korejah | časopis za človeško genetiko

Anonim

Predmeti

  • Epidemiologija
  • Genska variacija
  • Študije povezav z genomi
  • Vnetje črevesja

Izvleček

Caspase rekrutacijska domena (CARD), ki vsebuje protein 8 ( CARD8 ), je potencialni gen za tveganje za vnetno črevesno bolezen (KVČB) zaradi svoje vloge kot vnetje NALP3 in kot zaviralec jedrskega faktorja-kappa B. Prejšnje študije preučevanje povezave polimorfizma CARD8 z enim nukleotidom (SNP) (rs2043211, p.Cys10X) z IBD je prineslo mešane rezultate pri belcih, ki so lahko posledica interakcije z različicami NALP3 ali NOD2 (domena oligomerizacije, ki veže nukleotide 2). Da bi razumeli genetsko povezanost med CARD8 / NALP3 in IBD v Korejah , smo raziskali sedem CARD8 , štiri NALP3 in štiri NOD2 SNP pri 650 Crohnovi bolezni (CD), 660 bolnikov z ulceroznim kolitisom (UC) in 688 kontrol korejske populacije. rs2043211 iz CARD8 je pokazal pomembno povezavo z UC ( P = 0, 011; razmerje kvote = 1, 50, 95-odstotni intervali zaupanja = 1, 12-2, 00, P = 0, 006 v recesivnem modelu). V nasprotju s tem je bil SNP v intronu 1 rs1972619 povezan samo s CD-jem ( P = 0, 033). Noben SNP NALP3 ali NOD2 ni bil pomembno povezan s CD ali UC v korejski populaciji. Alel zaustavitve rs2043211 je bil povezan z višjimi serumskimi interleukin-1β le pri bolnicah z UC ( P = 0, 027). Naši podatki kažejo, da bi lahko variante CARD8 imele vlogo v patogenezi CD-ja in UC-ja v Korejcih.

Uvod

Vnetne črevesne bolezni (KVČB) so kronične ponavljajoče se motnje, ki jih klinično sestavljata Crohnova bolezen (CD) in ulcerozni kolitis (UC). Med obema podvrstama IBD je bolje dokumentiran genetski prispevek k tveganju za CD kot pri UC. 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 Do danes so študije povezav in povezav z genomi pri populacijah Kavkaza odkrile več kot 30 lokusov občutljivosti za CD. 1, 2, 3, 4, 5, 6 Nekateri geni za CD so bili tudi kavkaški povezani z UC. 11, 12

Čeprav so nedavne študije za povezavo z genom uspešno preslikale locike občutljivosti za KVČB, je treba še določiti nove potencialne gene. Sesanje proteina 8 (CARD), ki vsebuje kaskaško zaposlovanje (CARD), je potencialni gen za tveganje za KVČB, ki temelji na lokaciji genov (v lokusu IBD 6) in biološki funkciji. 13, 14, 15, 16 CARD8 deluje kot negativni regulator jedrskega faktorja-kappa B 13, 14 in je zaviralec apoptoze. 15, 16 Nedavne študije so pokazale, da je CARD8 v interakciji z NALP3 (NACHT; NAIP, CIIA, HET-E in TP1; protein zaviralca nevronske apoptoze (NAIP), aktivatorja transkripcije MHC razreda II (CIIA), lokus proteina nezdružljivosti iz Podospora anserina (HET -E) in domena, povezana s telomerazno beljakovino (TP1), protein, ki vsebuje levcin, beljakovine 3, ki vsebujejo pirino, in NOD2 (domena oligomerizacije, ki veže nukleotide 2), so člani skupine NOD-podobnih receptorjev, kar pomeni vlogo za CARD8 pri uravnavanju večih vnetnih poti. 17, 18

Faktor nekroze tumorja - α, interlevkin-1β (IL-1β) in IL-6 je značilno prekomerno produciran pri bolnikih s CD. 19 Proizvodnja zrelega IL-1β zahteva dva različna dogodka: okrepljeno sintezo prekurzorja, ki jo stimulira jedrski faktor-kappa B, in predelavo prekurzorja z aktivacijo kaspaze-1, ki jo izvaja proteinski kompleks kaspaza-1, znan kot vnetoma. 20 CARD8 ima pomembno vlogo pri uravnavanju citokinov z interakcijo z vnetim NALP3. 21, 22 Ta vnetje, ki ga sestavljajo CARD8, ASC (s apoptozo povezanim beljakovinam podobnim) in NALP3, uravnava aktivnost kaspaze-1 ter zorenje in sproščanje IL-1β. NOD2 je dodatno vključen v aktivacijo kaspaze-1 prek vnetje NALP1, sproščanje aktivnega IL-1β in transkripcijo pro-IL-1β. 23, 24 Poleg tega se je pokazalo, da CARD8 deluje z NOD2 in negativno uravnava signalizacijo, ki jo posreduje NOD2, tako da posega v oligomerizacijo NOD2. 18 Še vedno ni jasno, ali NOD2 za aktiviranje kaspaze-1 potrebuje NALP3 in / ali NALP1. Pan in sod. Slika 17 prikazuje, da sta NOD2 in NALP3 potrebna za izločanje IL-1β po stimulaciji mišjih makrofagov z muramil dipeptidi. Hsu et al. 23 poročalo, da je NOD2 sodeloval z NALP1, ne pa z NALP3.

Zgodnejše študije, ki so preučevale povezanost nesinonimnega eno-nukleotidnega polimorfizma (SNP) (C10X) v CARD8 in IBD, so poročale o konfliktnih rezultatih pri belcih. 25, 26, 27, A (p.C10X) varianta s Crohnovo boleznijo: študija v 3 neodvisnih evropskih kohortah. Vnetje. Črevesje. Dis. 14, 332–337 (2008). "Href = / Članki / jhg2010170 # ref28 aria-label =" Referenca 28 "data-track = kliknite data-track-label = link> 28 Nekateri so poročali o pozitivni povezanosti C10X s CD-jem; vendar so bili povezani aleli nedosledni. 25, 26 Druge študije, vključno s študijami povezave na celotnem genomu, niso našle dokazov o povezavi CD s katerim koli alelom. 5, 27, A (p.C10X) varianta s Crohnovo boleznijo: raziskava v 3 neodvisne evropske skupine: vnetje, črevesje. Dis 14, 332–337 (2008). " href = / Članki / jhg2010170 # ref28 aria-label = "Referenca 28" data-track = kliknite data-track-label = povezava> 28 V nadaljnjih poročilih so ugotovili, da so pacienti, homozigotični za polimorfizem C10X, še vedno izrazili imunoreaktivno izoformo CARD8, čeprav pri znižana raven. 29 V zadnjem času je bilo ugotovljeno, da so različice v drugi komponenti vnetoma NALP3, NALP3 in / ali NOD2 ter kombinacije genotipov NALP3 (Q705K) in CARD8 ( C10X ) povezane z resnostjo bolezni revmatoidnega artritisa 30, 31 in CD v odsotnost mutacij NOD2 . 32, 33

Analiza CARD8 , NALP3 in NOD2 pri korejskih bolnikih z UC in CD te študije ni pokazala nobenih dokazov o povezavi NALP3 ali NOD2 z nobeno boleznijo. Vendar je bil CARD8 v naši populaciji študije pozitivno povezan s CD in / ali UC. Zanimivo je, da so bili SNP, povezani z obema boleznima, ločeni, kar kaže na to, da se patogeni mehanizmi CD in UC prekrivajo, vendar ostajajo različno izraženi. Poleg tega smo opazili povezavo med prisotnostjo alel zaustavitve rs2043211 in višjo serumsko raven IL-1β, vendar le pri ženskah z UC.

Materiali in metode

Študijska populacija

Študijska populacija je obsegala 650 bolnikov s CD (441 moških in 209 žensk), 660 bolnikov z UC (344 moških in 316 žensk) in 688 nepovezanih zdravih kontrol (351 moških in 337 žensk). Del te kohorte smo že preučevali. 34, 35, 36 Vsi bolniki s CD ali UC so na kliničnih, radioloških, endoskopskih in histopatoloških merilih diagnosticirali v Kliniki za IBD Medicinskega centra Asan v Seulu, Koreja. 37, 38, 39 Bolniki z nedoločenim kolitisom so bili izključeni iz študije. Kot kontrola so bili uporabljeni posamezniki brez bolezni, ki jih zaposlijo iz zdravstvenega centra Medicinskega centra Asan (na podlagi rutinskih zdravstvenih pregledov). Fenotipske podskupine CD in UC sta določila dva neodvisna preiskovalca (SKY in SKP v CD; SKY in BDY v UC), zaslepljena na rezultate genotipne analize, z uporabo Montrealske klasifikacije z manjšimi spremembami. 35, 40 Na kratko, bolniki s CD-jem so bili razvrščeni glede na starost ob diagnozi (A1: 16 let; A2: 17–40 let; A3: 40 let), lokacija bolezni (L1, ileumu; L2, debelo črevo; L3, ileokolon) in vedenje bolezni (B1, vnetno; B2, strjevanje; B3, prodorno). Zgornji prebavili in modifikatorji perianalne bolezni Montrealskega sistema niso bili vključeni v našo klasifikacijsko shemo. UC bolniki so bili razvrščeni na podlagi največjega endoskopskega obsega kot E1 (ulcerozni proktitis), E2 (levostranski UC) ali E3 (obsežen UC). Demografske in klinične značilnosti študije so povzete v preglednici 1. Razporeditve spolov so bile statistično podobne v skupini UC in kontrolnih skupinah, ne pa tudi po starostni porazdelitvi. Niti razporeditve spola niti starosti niso bile podobne med CD in kontrolnimi skupinami. To študijo je odobril institucionalni pregledni odbor Medicinskega centra Asan in od vseh subjektov je bilo pridobljeno pisno informirano soglasje.

Tabela polne velikosti

Genotipizacija SNP

Genomsko DNK smo izolirali iz 5 ml vzorcev antikoagulirane venske krvi etilendiaminetetraocetne kisline s standardnimi metodami z uporabo ekstrakcije proteinaze K in fenol / kloroform. Skupno je bilo izbranih in genotipiziranih 16 SNPS, vključno s sedmimi CARD8 (rs1965759, rs1062808, rs4389238, rs2288877, rs2043211, rs2288876 in rs1972619), pet NALP3 (rs10802501, rs1539019, rs177355, rs20274295, rs2027429, rs2027429, rs2027429, rs2027529, rs2027429, rs2027429, rs2027429, rs2027429, rs2027429, rs2027429, rs2027529, rs2027529, Nr rs751271 in rs1077861). Vzorci so bili genotipizirani z uporabo laserske desorpcijske / ionizacijske laserske desorpcije / ionizacijskega sistema na osnovi masne spektrometrije, ki temelji na masnem spektrometriji (Sequenom, San Diego, Kalifornija) v Tehnološkem centru za analitično genetiko, bolnišnica Princess Margaret / University Health Network v Torontu, Kanada . Stopnje klicev genotipov so bile> 97, 5%: markerji rs1965759, rs1062808, rs4389238 in rs1972619 so bili vneseni v 601 kontrol, markerji rs2288877, rs2043211 in rs2288876 pa so bili vneseni v 688 kontrol.

Merjenje koncentracije IL-1β v serumu

Vzorci seruma so bili shranjeni pri –20 ° C. Kvantitativno odkrivanje IL-1β v serumu je bilo izvedeno s pomočjo človeškega kompleksa za preskušanje imunogorbentov IL-1β (BD Biosciences, San Diego, CA, ZDA). Na kratko, mikrotitrske plošče (BD Biosciences) so bile v skladu z navodili proizvajalca prevlečene s 100 μl na jamico mišjega monoklonskega protitelesa proti IL-1β. Standardi in serijsko razredčeni vzorci človeškega seruma so bili dodani v vdolbinice in inkubirani 2 uri pri sobni temperaturi. Po petkratnem spiranju s pralnim pufrom dodamo 100 μl biotiniliranega protičloveškega protitelesa IL-1β in ga 1 uro inkubiramo pri sobni temperaturi. Po drugem spiranju smo v jamice dodali 100 μl streptavidin-hrenove peroksidaze in inkubirali 30 minut. Barvo smo razvili z dodajanjem 100 μl substrata raztopine tetrametil-benzidina in barvno reakcijo zaustavili z dodatkom 50 μl raztopine STOP. Optična gostota je bila izmerjena pri 450 nm s pomočjo bralnika bralne plošče z imunosorbentom. Standardna krivulja je bila pripravljena na podlagi sedmih razredčenj IL-1β in določene koncentracije vzorca IL-1β. V preizkusu je bilo območje zaznavanja 1, 95–125 pg ml −1 .

Statistična analiza

Frekvencije genotipov med primeri in kontrolami so bile ločeno ocenjene glede skladnosti s tistimi, ki jih pričakuje ravnotežje Hardy-Weinberga z uporabo programske opreme SNP Alyze, različice 5.0 (Dynacom, Yokohama, Japonska). Povezave smo pregledali s primerjavo frekvenc alelov in genotipov iz različnih skupin preiskovancev z uporabo χ 2- testa s 1000 permutacijsko korekcijo v PLINK 2.050 (//pngu.mgh.harvard.edu/purcell/plink/) 41 in različici 4.2 od program Haploview (//www.broadinstitute.org/haploview/haploview). Alelne frekvence so bile primerjane med primeri in kontrolami z uporabo logistične regresije za izračun razmerja kvot, prilagojenega starosti in spolu (OR) in 95% intervalov zaupanja (CI). Analize genotipov in fenotipov so bile izvedene za SNP v primerih, ko je bila vrednost P- vrednosti manjša od 0, 2 pri analizi primerov. Poleg tega so bile izvedene logistične regresijske analize, da so preučili morebitne pomembne povezave med polimorfizmi in fenotipi bolezni.

Vrednosti neravnovesja dvojnih povezav, D ′ in r 2, in P- vrednosti, dobljene iz χ 2 -testov, smo izračunali s programskim paketom SNP Alyze in različico 4.2 programa Haploview. Neenakomernost ravnovesja med sedmimi polimorfizmi v CARD8, ki obsega 43 349 baznih parov na kromosomu 19q13.3, je bila precej nizka (0, 08 < r 2 <0, 51) (podatki niso prikazani). Rezultati analiz haplotipov so bili podobni rezultatom analiz z enim markerjem. Razlike v nivoju IL-1β med različnimi skupinami genotipov so bile ovrednotene z analizo variance in t- testa. Statistični pomen je bil predpostavljen pri P <0, 05. Podatki so bili analizirani z uporabo SPSS različice 18.0.0 za Windows (SPSS, Chicago, IL, ZDA).

Rezultati

Združitvena analiza polimorfizmov CARD8 s KVČB pri Korejcih

Analizirali so sedem SNP CARD8 pri 1 310 bolnikih s KVČB (650 s CD in 660 z UC) in 688 zdravih kontrol. Pregledani SNP niso bistveno odstopali od ravnotežja Hardy-Weinberga. Poleg tega noben SNP ni pokazal pomembne povezanosti s KVČB pri Korejcih. Razlike v frekvencah alel sedmih SNP med kontrolo in bolniki s KVČB so se gibale med 0, 1–1, 7% in niso dosegle statistično pomembnih ravni (podatki niso prikazani). Po ločenih analizah povezav za CD in UC je šest SNP pokazalo nasprotne alele tveganja, SNP, povezani s CD in UC, pa sta bili različni (tabeli 2 in 3).

Tabela polne velikosti

Tabela polne velikosti

Združitvena analiza polimorfizmov CARD8 z UC v Koreji

Porazdelitve genotipov sedmih SNP v UC so povzete v tabeli 2. Rezultati so izraženi kot prilagojeni OR (aOR) z uporabo logistične regresijske analize s prilagoditvijo glede na spol in starost.

Med sedmimi genotipiziranimi SNP-ji je rs2043211, nesinonimni SNP CARD8 ( C10X ), pokazal najpomembnejšo razliko v frekvenci alelov (4, 9%) med bolniki z UC in kontrolnimi skupinami ( P = 0, 011). Razlika med kontrolno in CD-skupino pa je znašala 1, 4% v nasprotni smeri (tabela 3). Razlika v frekvenci alel zaustavitve med bolniki s CD in UC je bila 6, 3% in statistično značilna ( P = 0, 001). AOR rs2043211 za TT genotip v primerjavi s kombiniranim genotipom (TA in AA) je znašal 1, 50 (95% CI = 1, 12–2, 00, P = 0, 006).

Nato smo analizirali povezanost po spolu. Edini marker, ki prikazuje statistično pomembno pomembno razliko med moškimi in ženskami, je bil rs2043211. Razlika je bila 6, 8% pri moških in 2, 8% pri ženskah, statistični pomen pa je bil tako viden samo pri moških ( P = 0, 011). AOR rs2043211 za genotip TT v primerjavi s kombiniranim genotipom (TA in AA) je bil pri moških 1, 70 (95% CI = 1, 16–2, 50, P = 0, 007) in 1, 27 (95% CI = 0, 81–1, 99, P = 0, 302 ) pri ženskah, kar kaže na to, da povečano tveganje za UC prenaša pretežno moški.

Združitvena analiza polimorfizmov CARD8 s CD v Korejcih

Porazdelitve genotipov sedmih SNP pri bolnikih s CD so povzete v preglednici 3. Rezultati so izraženi kot aOR s pomočjo logistične regresijske analize s prilagoditvijo glede na spol in starost.

H- 2- primerjava med frekvencami alelov in genotipov med bolniki s CD-jem in kontrolnimi skupinami je pokazala, da je rs1972619, ki se nahaja v intronu 1 od CARD8, imel mejni pomen ( P = 0, 033, P = 0, 022). Razlika v frekvenci alelov med kontrolnimi bolniki in bolniki s CD je znašala 3, 9%. Razlika med kontrolno in UC skupino je bila 2, 6% v nasprotni smeri (tabela 2). Zato je bila razlika v frekvenci alelov rs1972619 med bolniki z UC in CD (6, 5%) statistično značilna ( P = 4, 0 × 10 -4 ). AOR rs1972619 za GG genotip v primerjavi z genotipom AA je bil 2, 00 (95% CI = 1, 23–3, 26, P = 0, 005). Drugi SNP v intronu 8, rs4389238, je pokazal 3, 3-odstotno razliko v frekvenci alelov med kontrolnimi bolniki in bolniki s CD-jem. Manjši alel rs4389238 je pokazal mejno povezanost s CD-jem po recesivnem modelu (aOR = 2, 00, 95% CI = 1, 17–3, 41, P = 0, 012). Nasprotno pa nesinonimni SNP rs2043211, ki je bil pomembno povezan z UC, ni pokazal povezave s CD-jem, pogostost alela Cys pa je bila večja pri bolnikih s CD kot pri kontrolnih skupinah (0, 590 proti 0, 576).

Edini marker, ki je pokazal zelo pomembno razliko v frekvenci alelov med moškimi in ženskami, je bil rs4389238; konkretno je bila razlika 4, 6% pri moških in 2, 6% pri ženskah, kar kaže na mejni pomen pri moških ( P = 0, 041). AOR rs4389238 za genotip TT v primerjavi z genotipom CC je bil 3, 04 (95% CI = 1, 33–6, 93, P = 0, 008) pri moških in 1, 35 (95% CI = 0, 63–2, 89, P = 0, 439) pri ženskah, kar kaže na povečano tveganje za CD pri moških.

Polimorfizmi CARD8 in klinični fenotipi UC ali CD

Raziskali smo povezavo med kliničnimi fenotipi UC in rs2043211. V frekvencah alelov ali genotipov med skupinami UC, razvrščenih po maksimalnem endoskopskem obsegu, niso bile ugotovljene pomembne razlike. Raziskali smo tudi povezave med kliničnimi fenotipi CD in rs4389238 in rs1972619. Med podskupinami CD-jev, stratificiranih glede na lokacijo bolezni, vedenje in prisotnost perianalne fistule, ni bilo opaziti pomembnih razlik v frekvencah alelov ali genotipov.

Združitvena analiza polimorfizmov NALP3 in NOD s KVČB v Korejcih

V korejskih vzorcih smo genotipizirali pet SNP iz NALP3 . Med temi SNP-ji rs76291085 v Korejcih ni bil polimorfen. Alelna frekvenca nesinonimnega SNP rs35829419 (Q705K) NALP3 je bila 0, 002 pri CD-ju in 0, 003 pri bolnikih z UC, vendar 0 pri kontrolnih skupinah. V združevalnih analizah štirje SNP niso pokazali pomembne povezanosti ne s CD ne z UC (dodatna tabela 1). Poleg tega noben od štirih genotipov SNP iz NOD2 ni bil povezan s CD (dodatna tabela 2).

Merjenje serumskih koncentracij IL-1β

Za raziskovanje funkcionalnega pomena CARD8 nesinonimnega SNP rs2043211 (C10X) na aktivnost kaspaze-1 smo izmerili serumske ravni IL-1β pri 70 kontrolnih skupinah, 107 CD in 106 UC bolnikov, da bi ocenili povezanost z genotipom. Ravni IL-1β so bile pri CD (povprečno ± sd, 7, 0 ± 17, 3 pg ml -1 ) in bolnikih z UC (4, 9 ± 8, 4 pg ml -1 ) v primerjavi s kontrolnimi skupinami (1, 0 ± 6, 8 pg ml -1, P = 0, 010 za tako CD kot UC bolniki). Vendar razlika v povprečni ravni IL-1β med bolniki z UC in CD ni bila statistično značilna ( P = 0, 265). Po analizi razlike med ravnijo IL-1β in genotipa pri bolnikih s CD in UC se serumska raven IL-1β pri bolnikih z UC ali CD s tremi genotipi rs2043211 ni razlikovala (TT, 6, 6 ± 11, 9 pg ml -1 ; TA, 5, 3 ± 4, 1 pg ml -1, AA, 2, 8 ± 4, 8 pg ml -1, P = 0, 116 za bolnike z UC, TT, 4, 1 ± 9, 7 pg ml -1 ; TA, 12, 9 ± 29, 5 pg ml -1 ; AA, 5, 5 ± 10, 1 pg ml −1, P = 0, 114 za bolnike s CD) Kot je prikazano v preglednici 4, je kombinirana analiza heterozigotov in homozigotov pokazala pozitivno povezanost med prisotnostjo zaustavitvenega alela rs2043211 in višjo koncentracijo IL-1β v serumu samo pri bolnikih z UC (TT + TA 6, 1 ± 9, 8 pg ml -1, AA, 2, 8 ± 4, 8 pg ml -1, P = 0, 048). Poleg tega smo opazili pomembnejšo povezavo pri analizi le glede na spol samo pri bolnikih z UC. Ravni IL-1β v serumu pri bolnicah z UC pri treh genotipih rs2043211 so bile izrazito različne ( P = 0, 027).

Tabela polne velikosti

Diskusija

Od sedmih SNP-jev CARD8, testiranih v tej študiji, sta rs2043211 in rs1972619 pokazala statistično pomembne povezave z UC oziroma CD-jem. Zanimivo je, da se SNP-ji, povezani z UC in CD-jem, v Korejcih niso prekrivali. Poleg tega so bili aleli za tveganje šestih od sedmih SNP pri bolnikih z UC in CD nasprotni drug drugemu. Razlike v frekvencah alelov rs2043211 in rs1972619 med bolniki z UC in CD so znašale 6, 3% in 6, 5% in so bile statistično značilne ( P = 0, 001, P = 4 × 10–4 ). Naši podatki o nasprotni smeri šestih SNP-jev med bolniki z UC in CD-jem kažejo na različne vloge CARD8 pri teh povezanih boleznih. Zlasti dejstvo, da so bili učinki nasprotni, je povzročilo odsotnost asociacijskega signala ob analizi kombiniranih vzorcev CD in UC, kar kaže, da je treba previdno preučiti prejšnja negativna poročila o genetskih povezavah s KVČB. Kolikor nam je znano, je to prvo poročilo, ki je pokazalo, da se aleli, povezani z UC in CD, razlikujejo po vzorcu učinka, in to je prva analiza genotipa CARD8 pri azijski populaciji.

McGovern in sod. ugotovili, da je skupni alel A (Cys) povezan s CD-jem 25, medtem ko Fisher et al. dokazali povezanost redkega alela T (stop) s KVČB. 26 poznejših študij o nemških in norveških bolnikih z IBD, 27 in treh neodvisnih evropskih kohortah, nemški, nizozemski in madžarski, različica A (p.C10X) s Crohnovo boleznijo: študija na treh neodvisnih evropskih kohortah. Vnetje. Črevesje. Dis. 14, 332–337 (2008). "Href = / Članki / jhg2010170 # ref28 aria-label =" Referenca 28 "data-track = kliknite data-track-label = link> 28 ni uspelo ponoviti povezave rs2043211 s CD ali Nedavne študije kažejo, da so lahko ti konfliktni rezultati posledica interakcije rs2043211 z različicami izgube funkcije v NOD2 in SNP-ja za povečanje funkcije (rs35829419, Q705K) v NALP3 . Švedsko poročilo je pokazalo, da moški nosijo oba Aleli C10X in Q705K v CARD8 in NALP3 ter divji tip NOD so bili povečano ogroženi posebej za CD 32 Druga študija, izvedena na Novi Zelandiji, je odkrila zaščitne učinke manjšega alela CARD8 rs2043211 ali NALP3 rs35829419 proti CD-ju v povezavi z velikim alelom. 33. Poleg tega so bili učinki intenzivnejši, če ni bilo mutacij NOD2 . 33 NOD2 na kromosomu 16 je bil prvi gen za občutljivost na CD, ugotovljen pri bolnikih evropskega izvora. 42, 43, 44 Vendar pa ta ugotovitev ni se je ponatisnil v azijskem prebivalstvu . 45, 46, 47 Pregled štirih SNP-jev s strani NOD2 ni našel nobenih dokazov o povezavi s CD-jem v Korejcih (dodatna tabela 2). Poleg tega nismo opazili povezave genotipa NALP3 s CD ali UC pri Korejah (dodatna tabela 1). Pogostost alela tveganja NALP3 , rs35829419 (Q705K), v kontrolni populaciji je bila pri belcih višja kot pri Korejcih (0, 04–0, 07 proti 0, 00), 31, 32, 33, medtem ko je bila frekvenca alela zaustavitve rs2043211 pri kontrolah višja pri Azijih kot pri belcih (0, 42 proti 0, 32–0, 34). 25, 26, 27, A (p.C10X) varianta s Crohnovo boleznijo: študija v 3 neodvisnih evropskih kohortah. Vnetje. Črevesje. Dis. 14, 332–337 (2008). "Href = / Članki / jhg2010170 # ref28 aria-label =" Referenca 28 "data-track = kliknite data-track-label = link> 28 Ker smo med UC opredelili le štiri in tri heterozygote bolnikov s CD in CD-jev ni bilo mogoče preučiti kombiniranih učinkov genotipa NALP3 in CARD8 pri Korejah, ki še dodatno poudarjajo razlike v genetskem ozadju bolnikov s KVČB v azijskih in zahodnih državah.

Druga zanimiva ugotovitev te študije je razlika med spoloma v povezavi rs2043211 in rs4389238 z UC in CD v Koreji. Ena izmed dobro znanih razlik med azijskimi in kavkaškimi bolniki s CD je prevlado moških med Azijci. Konkretno je v Koreji in na Japonskem očitno razmerje med moškimi in ženskami približno 2: 1 v primerjavi s približno 1: 1 v zahodnih državah. 48, 49, 50 V nasprotju s tem je incidenca UC pri Korejcih primerljiva med moškimi in ženskami. 49 Ni znano, ali to razliko med spoloma pri pojavnosti KVČB povzročajo okoljski dejavniki, genetski vplivi ali kombinacija teh parametrov. Opazili smo razlike med spoloma v občutljivosti za UC, povezano z rs2043211 in občutljivostjo za CD z rs4389238. V obeh primerih je bilo tveganje večje pri moških (aOR = 1, 70, P = 0, 007 za rs2043211, aOR = 3, 04, P = 0, 008 za rs4389238). Najstarejše poročilo o razlikah med spoloma pri dovzetnosti za KVČB med zahodno populacijo je pokazalo povečano tveganje za razvoj CD pri moških z aleli C10X in Q705K CARD8 oziroma NALP3 in divjim NOD2. 32 Čeprav se SNP-ji, vključeni v CD v Koreji, razlikujejo od tistih pri kavkaških bolnikih s CD-jem, so v različicah CARD8 prikazane razlike v občutljivosti spolov na CD v kavkaški in korejski populaciji.

Glede na vlogo, ki jo je imel CARD8 pri sestavljanju vnetja NALP3 in interakcij CARD8 z NOD2, smo tudi ugotovili, ali SNC -ji, povezani z UC ali CD, vplivali na obdelavo IL-1β z merjenjem serumskih ravni IL-1β pri bolnikih s KVČB in kontrolo. Serumske koncentracije IL-1β so bile pri bolnikih z UC ( P = 0, 010) in CD ( P = 0, 010) bistveno višje kot pri kontrolnih skupinah. Vendar razlike med nivoji IL-1β pri bolnikih z UC in CD niso bile statistično pomembne ( P = 0, 265). Ravni IL-1β, razvrščene po spolu, se niso bistveno razlikovale niti pri bolnikih z UC ( P = 0.742) niti pri bolnikih s CD ( P = 0, 071). Analiza odstopanja med ravnmi IL-1β in genotipi je pokazala, da se zdi, da je stopalni alel rs2043211 koreliran z višjimi serumskimi nivoji IL-1β pri ženskah z UC ( P = 0, 027). Vendar pa ni bilo opaziti povezave med genotipi rs2043211 ali rs1972619 in serumskimi nivoji IL-1β pri bolnikih s CD. Čeprav je bila povezava rs2043211 z UC pomembnejša pri moških kot pri ženskah, se je povezava med ravnijo IL-1β v serumu in genotipom izkazala za pomembnejšo pri ženskah z UC. To odstopanje je lahko posledica polimorfizmov, ki so prisotni v genih, povezanih z drugimi funkcijami CARD8.

Našo študijo je omejilo pomanjkanje informacij o bolezni bolezni pri bolnikih z UC in CD v obdobju odvzema seruma. Ne moremo izključiti možnosti pristranskosti serumskih ravni IL-1β, ki jih je mogoče pripisati različnim nivojem aktivnosti bolezni pri bolnikih v času vzorčenja. Poleg tega ne vemo, ali SNP-ji, povezani z UC in CD, kažejo učinke izgube ali povečanja funkcije. Bolniki s CD-jem, ki prenašajo alel rs2043211, izražajo imunoreaktivno izoformo CARD8 in nekoliko znižano raven mRNA. 29 Vendar funkcionalni pomen tega zaustavitvenega alela pri bolnikih z UC in vloga, ki jo ima rs1972619 pri korejskih bolnikih s CD, še vedno ni treba določiti.

Če povzamemo, smo potrdili prej opisane povezave med polimorfizmi CARD8 in UC ali CD v korejski populaciji. Zanimivo je, da se SNP, povezani z obema boleznoma, niso prekrivali. Čeprav se biološke funkcije SNC -jev, povezanih z UC ali CD- jem, še vedno določajo, alelni prekrivni aleli med bolniki z UC in CD kažejo, da imajo te klinično povezane bolezni različne patogene mehanizme. Nadaljnje študije so bistvene za razjasnitev posebnih vlog, ki jih igrajo različice CARD8 v UC in CD.

Dodatne informacije

Word dokumenti

  1. 1.

    Dopolnilne tabele 1–2

    Dodatne informacije spremljajo prispevek na spletni strani Journal of Human Genetics (//www.nature.com/jhg)